More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1212 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_00060  translation elongation factor Tu  86.84 
 
 		 395 aa  693    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.937819  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1212  elongation factor Tu  100 
 
 		 395 aa  806    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0387  elongation factor Tu  81.01 
 
 		 395 aa  674    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  80.46 
 
 		 395 aa  663    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4484  translation elongation factor Tu  80.51 
 
 		 395 aa  664    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000251988  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3456  elongation factor Tu  81.01 
 
 		 395 aa  667    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0019954  normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3175  elongation factor Tu  78.93 
 
 		 395 aa  646    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1936  elongation factor Tu  85.57 
 
 		 395 aa  702    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1403  elongation factor Tu  77.72 
 
 		 395 aa  641    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1700  translation elongation factor Tu  77.41 
 
 		 395 aa  608  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  69.8 
 
 		 395 aa  594  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  71.36 
 
 		 400 aa  596  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  71.36 
 
 		 400 aa  596  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  70.5 
 
 		 400 aa  591  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  70.63 
 
 		 394 aa  592  1e-168  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  71.18 
 
 		 399 aa  593  1e-168  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 399 aa  592  1e-168  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 399 aa  593  1e-168  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  70.28 
 
 		 397 aa  592  1e-168  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  70.71 
 
 		 397 aa  589  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  68.5 
 
 		 400 aa  588  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  69 
 
 		 400 aa  590  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  71.18 
 
 		 399 aa  590  1e-167  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  70.13 
 
 		 397 aa  585  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  70.68 
 
 		 399 aa  585  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  70.68 
 
 		 399 aa  585  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  70.68 
 
 		 399 aa  585  1e-166  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl621  elongation factor Tu  69.97 
 
 		 394 aa  586  1e-166  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1101  translation elongation factor Tu  74.87 
 
 		 398 aa  585  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000113146  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  71.36 
 
 		 397 aa  586  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  71.36 
 
 		 397 aa  586  1e-166  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  70.63 
 
 		 395 aa  587  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  70.63 
 
 		 395 aa  587  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  69.85 
 
 		 400 aa  586  1e-166  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  69.85 
 
 		 400 aa  587  1e-166  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  68.69 
 
 		 397 aa  585  1e-166  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0359  elongation factor Tu  70.96 
 
 		 391 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  70.03 
 
 		 396 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  69.7 
 
 		 396 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1707  elongation factor Tu  70.96 
 
 		 391 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1714  elongation factor Tu  70.96 
 
 		 391 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0840  translation elongation factor Tu  74.62 
 
 		 398 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  69.5 
 
 		 400 aa  581  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  69.7 
 
 		 396 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  69.7 
 
 		 396 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  69.7 
 
 		 396 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0331  elongation factor Tu  70.96 
 
 		 391 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.386625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0345  elongation factor Tu  70.96 
 
 		 391 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.918879  normal  0.827994 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  70 
 
 		 400 aa  580  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  68 
 
 		 400 aa  579  1e-164  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  68 
 
 		 400 aa  579  1e-164  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  68.59 
 
 		 400 aa  580  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2536  elongation factor Tu  70.96 
 
 		 391 aa  580  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  70 
 
 		 400 aa  579  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  69.87 
 
 		 396 aa  578  1e-164  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  70.03 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  70.03 
 
 		 396 aa  577  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  68.59 
 
 		 400 aa  580  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  69.6 
 
 		 400 aa  579  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  70.05 
 
 		 394 aa  579  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  70.05 
 
 		 394 aa  579  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2549  elongation factor Tu  70.96 
 
 		 391 aa  580  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.812394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  69.6 
 
 		 399 aa  580  1e-164  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  70.03 
 
 		 396 aa  577  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  70.05 
 
 		 394 aa  578  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  70.05 
 
 		 394 aa  578  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  69.77 
 
 		 397 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5122  translation elongation factor Tu  69.19 
 
 		 397 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.821409 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  70.38 
 
 		 396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  68.69 
 
 		 397 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0154  elongation factor Tu  67.94 
 
 		 395 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  69.77 
 
 		 397 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  69.27 
 
 		 396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  69.27 
 
 		 396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  68.77 
 
 		 396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  70.63 
 
 		 395 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  68.25 
 
 		 400 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  69.27 
 
 		 396 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  69.27 
 
 		 396 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  69.44 
 
 		 396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  69.44 
 
 		 396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  69.27 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  70.38 
 
 		 396 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  69.27 
 
 		 396 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  68.51 
 
 		 396 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  68.51 
 
 		 396 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  69.8 
 
 		 394 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  70.13 
 
 		 395 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  68.18 
 
 		 396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  69.19 
 
 		 396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  68.18 
 
 		 396 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0792  elongation factor Tu  68.67 
 
 		 399 aa  572  1.0000000000000001e-162  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.640379  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0792  elongation factor Tu  68.96 
 
 		 396 aa  571  1.0000000000000001e-162  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.476652  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  65.43 
 
 		 405 aa  569  1e-161  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  68.26 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  65.43 
 
 		 405 aa  569  1e-161  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3864  elongation factor Tu  68.18 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3874  elongation factor Tu  68.18 
 
 		 396 aa  568  1e-161  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  69.54 
 
 		 394 aa  569  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  69.54 
 
 		 394 aa  570  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>