More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2066 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  76.4 
 
 
394 aa  636    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2066  elongation factor Tu  100 
 
 
393 aa  791    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000429802  normal  0.421241 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0178  elongation factor Tu  90.59 
 
 
393 aa  697    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000251957  normal  0.724836 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1853  elongation factor Tu  88.3 
 
 
393 aa  687    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000429764  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  76.52 
 
 
396 aa  634    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  76.52 
 
 
396 aa  634    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2298  elongation factor Tu  92.37 
 
 
393 aa  713    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0189687  hitchhiker  0.00385898 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0287  elongation factor Tu  89.31 
 
 
393 aa  693    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118112  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2231  elongation factor Tu  91.09 
 
 
393 aa  698    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000169519  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2425  elongation factor Tu  90.59 
 
 
393 aa  697    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00155589  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  75.76 
 
 
396 aa  631  1e-180  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  75.76 
 
 
396 aa  631  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  75.76 
 
 
396 aa  631  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  75.76 
 
 
396 aa  631  1e-180  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  76.14 
 
 
396 aa  622  1e-177  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  76 
 
 
400 aa  619  1e-176  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  74.43 
 
 
395 aa  620  1e-176  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  75.38 
 
 
396 aa  614  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  75.89 
 
 
396 aa  616  1e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  74.75 
 
 
396 aa  616  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  75.38 
 
 
396 aa  614  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  72.61 
 
 
399 aa  617  1e-175  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1948  elongation factor Tu  75.57 
 
 
395 aa  617  1e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  73.74 
 
 
396 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  73.74 
 
 
396 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  73.05 
 
 
397 aa  611  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  74.49 
 
 
396 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  71.61 
 
 
399 aa  611  9.999999999999999e-175  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  73.99 
 
 
396 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  73.99 
 
 
396 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  73.99 
 
 
396 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  73.99 
 
 
396 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  74.24 
 
 
396 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0387  elongation factor Tu  71.65 
 
 
395 aa  610  1e-173  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  74.56 
 
 
400 aa  608  1e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  72.5 
 
 
400 aa  608  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  72.5 
 
 
400 aa  608  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  73.48 
 
 
396 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  74.75 
 
 
396 aa  610  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  74.75 
 
 
400 aa  610  1e-173  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  73.99 
 
 
396 aa  608  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  73.48 
 
 
396 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  74.75 
 
 
396 aa  610  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  73.6 
 
 
395 aa  609  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  73.6 
 
 
395 aa  609  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  73.99 
 
 
396 aa  608  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  72.01 
 
 
394 aa  608  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  72.01 
 
 
394 aa  608  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  74.56 
 
 
400 aa  608  1e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  72.01 
 
 
394 aa  607  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  72.01 
 
 
394 aa  607  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  71.61 
 
 
399 aa  609  1e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1066  elongation factor Tu  77.78 
 
 
396 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093515  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  74.06 
 
 
397 aa  607  9.999999999999999e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  72.98 
 
 
397 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0918  elongation factor Tu  78.03 
 
 
396 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1053  elongation factor Tu  77.78 
 
 
396 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0848244  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  72.98 
 
 
396 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  72.98 
 
 
396 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  72.98 
 
 
397 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  75.76 
 
 
396 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  75.76 
 
 
396 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  72.54 
 
 
397 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  74.06 
 
 
397 aa  607  9.999999999999999e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3343  elongation factor Tu  77.78 
 
 
396 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311584 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3330  elongation factor Tu  77.78 
 
 
396 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.91579e-16 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1672  elongation factor Tu  73.62 
 
 
399 aa  601  1.0000000000000001e-171  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000990168  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2859  elongation factor Tu  76.77 
 
 
396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165187  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2871  elongation factor Tu  76.77 
 
 
396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.373737  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  70.68 
 
 
399 aa  601  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  70.68 
 
 
399 aa  601  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0320  elongation factor Tu  71.68 
 
 
399 aa  601  1.0000000000000001e-171  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.716365  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  73.92 
 
 
397 aa  601  1.0000000000000001e-171  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  73.3 
 
 
396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  74.19 
 
 
399 aa  602  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1403  elongation factor Tu  72.66 
 
 
395 aa  601  1.0000000000000001e-171  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  74.19 
 
 
400 aa  602  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  70.68 
 
 
399 aa  601  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  72.73 
 
 
396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  72.73 
 
 
396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0678  elongation factor Tu  77.02 
 
 
396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.596975  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0792  elongation factor Tu  74.17 
 
 
396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.476652  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  73.3 
 
 
396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1541  elongation factor Tu  76.83 
 
 
397 aa  603  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.161942  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1553  elongation factor Tu  76.83 
 
 
397 aa  603  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000482346  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0665  elongation factor Tu  77.02 
 
 
396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.835908  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  72.47 
 
 
396 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000712008  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1331  elongation factor Tu  76.26 
 
 
396 aa  599  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0012019  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  72.47 
 
 
396 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  72.01 
 
 
394 aa  600  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1344  elongation factor Tu  76.26 
 
 
396 aa  599  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.536684  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3778  elongation factor Tu  72.47 
 
 
396 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000176887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3794  elongation factor Tu  72.47 
 
 
396 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000750152  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1707  elongation factor Tu  73.42 
 
 
391 aa  598  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.901691  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  72.73 
 
 
396 aa  600  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  72.47 
 
 
396 aa  598  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  72.47 
 
 
396 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  72.47 
 
 
396 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000373215  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  72.47 
 
 
396 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  72.73 
 
 
396 aa  600  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>