More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1553 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  78.09 
 
 		 396 aa  645    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  78.09 
 
 		 396 aa  645    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  78.84 
 
 		 396 aa  659    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0706  elongation factor Tu  81.36 
 
 		 397 aa  643    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000240692  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  78.59 
 
 		 397 aa  660    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  78.84 
 
 		 397 aa  663    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  78.84 
 
 		 396 aa  659    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0695  elongation factor Tu  81.36 
 
 		 397 aa  643    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000151586  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  75.82 
 
 		 396 aa  635    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  76.32 
 
 		 396 aa  636    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  76.32 
 
 		 396 aa  636    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  78.5 
 
 		 400 aa  654    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  76.57 
 
 		 396 aa  640    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  79.35 
 
 		 396 aa  643    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  79.35 
 
 		 396 aa  643    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  77.08 
 
 		 396 aa  643    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  77.08 
 
 		 396 aa  643    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  76.57 
 
 		 396 aa  640    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  78.84 
 
 		 396 aa  659    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  77.08 
 
 		 396 aa  643    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  76.83 
 
 		 396 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  76.83 
 
 		 396 aa  643    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  76.07 
 
 		 396 aa  638    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  79.09 
 
 		 396 aa  657    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  78.84 
 
 		 396 aa  659    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  79.09 
 
 		 396 aa  657    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1541  elongation factor Tu  100 
 
 		 397 aa  800    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.161942  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1553  elongation factor Tu  100 
 
 		 397 aa  800    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000482346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  77.08 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  76.83 
 
 		 397 aa  632  1e-180  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  77.08 
 
 		 396 aa  631  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  77.47 
 
 		 396 aa  634  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  76.83 
 
 		 397 aa  632  1e-180  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  77.47 
 
 		 396 aa  634  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  77.08 
 
 		 397 aa  630  1e-179  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  74.31 
 
 		 396 aa  628  1e-179  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  74.31 
 
 		 396 aa  628  1e-179  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  77.08 
 
 		 397 aa  630  1e-179  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1053  elongation factor Tu  78.59 
 
 		 396 aa  625  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0848244  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  75.06 
 
 		 396 aa  624  1e-178  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0447  elongation factor Tu  78.84 
 
 		 397 aa  625  1e-178  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  75.06 
 
 		 396 aa  624  1e-178  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  76.2 
 
 		 396 aa  627  1e-178  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0918  elongation factor Tu  79.09 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 396 aa  626  1e-178  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3330  elongation factor Tu  78.59 
 
 		 396 aa  624  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.91579e-16 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0699  elongation factor Tu  77.44 
 
 		 399 aa  624  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495422  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3343  elongation factor Tu  78.59 
 
 		 396 aa  624  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311584 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1066  elongation factor Tu  78.59 
 
 		 396 aa  625  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093515  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3923  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 397 aa  620  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.375909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  76.32 
 
 		 396 aa  621  1e-177  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  76 
 
 		 400 aa  622  1e-177  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0665  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  623  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.835908  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0686  elongation factor Tu  77.19 
 
 		 399 aa  624  1e-177  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.23848e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  76.32 
 
 		 396 aa  621  1e-177  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1447  elongation factor Tu  78.09 
 
 		 397 aa  621  1e-177  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3911  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 397 aa  620  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0156728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0678  elongation factor Tu  77.83 
 
 		 396 aa  623  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.596975  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  76 
 
 		 400 aa  622  1e-177  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  75.31 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  75.31 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1628  elongation factor Tu  78.84 
 
 		 397 aa  619  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06090  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 397 aa  620  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.878067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06230  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 397 aa  620  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141067  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1344  elongation factor Tu  77.58 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.536684  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1331  elongation factor Tu  77.58 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0012019  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  75.57 
 
 		 396 aa  620  1e-176  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  75.82 
 
 		 396 aa  620  1e-176  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  76.32 
 
 		 395 aa  618  1e-176  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  76.32 
 
 		 395 aa  618  1e-176  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  75.51 
 
 		 394 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  75.51 
 
 		 394 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2859  elongation factor Tu  77.08 
 
 		 396 aa  617  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165187  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2871  elongation factor Tu  77.08 
 
 		 396 aa  617  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.373737  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 396 aa  614  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1948  elongation factor Tu  74.43 
 
 		 395 aa  614  1e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 394 aa  617  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 396 aa  616  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  75.5 
 
 		 400 aa  617  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  75.57 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 396 aa  614  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  74 
 
 		 400 aa  614  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000814669  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  75.25 
 
 		 394 aa  617  1e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 396 aa  616  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  74 
 
 		 400 aa  615  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  73.3 
 
 		 394 aa  616  1e-175  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  75.57 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  75.06 
 
 		 396 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0380  elongation factor Tu  76.32 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0039  elongation factor Tu  74.81 
 
 		 396 aa  611  9.999999999999999e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000135478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>