More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0287 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2298  elongation factor Tu  89.06 
 
 		 393 aa  691    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0189687  hitchhiker  0.00385898 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2231  elongation factor Tu  95.42 
 
 		 393 aa  733    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000169519  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2066  elongation factor Tu  89.31 
 
 		 393 aa  687    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000429802  normal  0.421241 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0287  elongation factor Tu  100 
 
 		 393 aa  792    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.118112  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0178  elongation factor Tu  92.37 
 
 		 393 aa  715    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000251957  normal  0.724836 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1853  elongation factor Tu  95.17 
 
 		 393 aa  731    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000429764  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2425  elongation factor Tu  94.66 
 
 		 393 aa  726    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00155589  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1048  elongation factor Tu  75.38 
 
 		 394 aa  632  1e-180  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000767064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  77.02 
 
 		 396 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  77.02 
 
 		 396 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  76.52 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  76.52 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  76.52 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  76.52 
 
 		 396 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  76.5 
 
 		 400 aa  625  1e-178  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  75.75 
 
 		 400 aa  619  1e-176  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  74.18 
 
 		 395 aa  614  1e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  74.31 
 
 		 400 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  75 
 
 		 396 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1224  elongation factor Tu  74.62 
 
 		 395 aa  612  9.999999999999999e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000327734  unclonable  0.0000129395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4684  elongation factor Tu  74.62 
 
 		 395 aa  612  9.999999999999999e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000125263  normal  0.0270964 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  74.31 
 
 		 400 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  74.06 
 
 		 397 aa  608  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  74.06 
 
 		 397 aa  608  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  73.5 
 
 		 400 aa  608  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  73.5 
 
 		 400 aa  609  1e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  73.86 
 
 		 396 aa  609  1e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  76.52 
 
 		 396 aa  607  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  76.52 
 
 		 396 aa  607  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  73.74 
 
 		 396 aa  607  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  73.74 
 
 		 396 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  72.01 
 
 		 394 aa  609  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  72.01 
 
 		 394 aa  609  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  72.01 
 
 		 394 aa  608  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  72.01 
 
 		 394 aa  608  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  72.73 
 
 		 396 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  72.73 
 
 		 396 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  74.37 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  73.23 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  73.23 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4484  translation elongation factor Tu  73.92 
 
 		 395 aa  606  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000251988  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  72.98 
 
 		 396 aa  604  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  74.37 
 
 		 396 aa  607  9.999999999999999e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1948  elongation factor Tu  74.3 
 
 		 395 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  74.37 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0387  elongation factor Tu  72.41 
 
 		 395 aa  603  1.0000000000000001e-171  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  74.37 
 
 		 400 aa  601  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  74.37 
 
 		 399 aa  602  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  72.29 
 
 		 397 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  72.47 
 
 		 396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  72.47 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  72.47 
 
 		 396 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  70.85 
 
 		 399 aa  602  1.0000000000000001e-171  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  73.74 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  73.74 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  73.23 
 
 		 396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  72.26 
 
 		 394 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  73.23 
 
 		 396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0792  elongation factor Tu  73.66 
 
 		 396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.476652  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  72.66 
 
 		 395 aa  598  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  71.11 
 
 		 405 aa  598  1e-170  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  71.11 
 
 		 405 aa  598  1e-170  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  73.12 
 
 		 400 aa  599  1e-170  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  72.01 
 
 		 394 aa  600  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  72.26 
 
 		 394 aa  600  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  73 
 
 		 400 aa  600  1e-170  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3330  elongation factor Tu  77.02 
 
 		 396 aa  597  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.91579e-16 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  71.79 
 
 		 397 aa  598  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  72.47 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3456  elongation factor Tu  72.91 
 
 		 395 aa  600  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0019954  normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3343  elongation factor Tu  77.02 
 
 		 396 aa  597  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311584 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  72.47 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  72.26 
 
 		 394 aa  600  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0918  elongation factor Tu  77.27 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  72.25 
 
 		 400 aa  598  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  72.25 
 
 		 400 aa  599  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1066  elongation factor Tu  77.27 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093515  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1053  elongation factor Tu  77.27 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0848244  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  72.22 
 
 		 397 aa  600  1e-170  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  72.22 
 
 		 397 aa  600  1e-170  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0665  elongation factor Tu  76.77 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.835908  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0678  elongation factor Tu  76.77 
 
 		 396 aa  598  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.596975  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06090  elongation factor Tu  71.28 
 
 		 397 aa  595  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.878067  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  71.72 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  72.54 
 
 		 397 aa  597  1e-169  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  73.07 
 
 		 400 aa  596  1e-169  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  73.5 
 
 		 400 aa  595  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  73.92 
 
 		 395 aa  595  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  69.6 
 
 		 399 aa  596  1e-169  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  73.07 
 
 		 400 aa  595  1e-169  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06230  elongation factor Tu  71.28 
 
 		 397 aa  595  1e-169  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141067  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  72.22 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  71.72 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  71.72 
 
 		 396 aa  594  1e-169  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  72.22 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1403  elongation factor Tu  72.66 
 
 		 395 aa  596  1e-169  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2157  elongation factor Tu  71.75 
 
 		 400 aa  594  1e-169  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.154382  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2170  elongation factor Tu  71.75 
 
 		 400 aa  594  1e-169  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0151946  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  73.5 
 
 		 400 aa  595  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  72.25 
 
 		 400 aa  597  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>