More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3299 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3299  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumB  100 
 
 		 411 aa  828    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1285  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumB  61.31 
 
 		 374 aa  444  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00745486  normal  0.0225207 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3753  23S rRNA methyluridine methyltransferase  59.18 
 
 		 379 aa  435  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1142  23S rRNA methyluridine methyltransferase  53.66 
 
 		 375 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000767516 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1448  23S rRNA methyluridine methyltransferase  58.5 
 
 		 376 aa  399  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.305727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4319  23S rRNA methyluridine methyltransferase  56.59 
 
 		 372 aa  396  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.255085 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2390  23S rRNA methyluridine methyltransferase  51.82 
 
 		 382 aa  393  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.437044 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2381  23S rRNA methyluridine methyltransferase  49.64 
 
 		 376 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.624238  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1697  23S rRNA methyluridine methyltransferase  47.45 
 
 		 376 aa  371  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1568  23S rRNA methyluridine methyltransferase  49.14 
 
 		 376 aa  369  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2725  23S rRNA methyluridine methyltransferase  49.14 
 
 		 376 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2640  23S rRNA methyluridine methyltransferase  49.14 
 
 		 376 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000831969  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1963  23S rRNA methyluridine methyltransferase  46.23 
 
 		 375 aa  361  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.333439  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1650  23S rRNA methyluridine methyltransferase  47.33 
 
 		 375 aa  359  6e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.401467 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0931  23S rRNA methyluridine methyltransferase  46.36 
 
 		 375 aa  356  5e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2783  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumB  46.36 
 
 		 375 aa  355  1e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.720743  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00864  23S rRNA m(5)U747-methyltransferase  46.36 
 
 		 375 aa  354  2e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00870  hypothetical protein  46.36 
 
 		 375 aa  354  2e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0962  23S rRNA methyluridine methyltransferase  46.36 
 
 		 375 aa  353  2e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2737  23S rRNA methyluridine methyltransferase  46.36 
 
 		 375 aa  353  2e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.438081  normal  0.757831 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1015  23S rRNA methyluridine methyltransferase  46.47 
 
 		 375 aa  354  2e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0887  23S rRNA methyluridine methyltransferase  46.36 
 
 		 375 aa  352  8e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.848351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2472  23S rRNA methyluridine methyltransferase  45.63 
 
 		 375 aa  348  1e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112425  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1373  23S rRNA methyluridine methyltransferase  44.77 
 
 		 375 aa  338  8e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0955  23S rRNA methyluridine methyltransferase  44.28 
 
 		 376 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1713  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumB  46.52 
 
 		 379 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0987  23S rRNA methyluridine methyltransferase  44.53 
 
 		 375 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0919  23S rRNA methyluridine methyltransferase  44.53 
 
 		 375 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.983812  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1035  23S rRNA methyluridine methyltransferase  44.28 
 
 		 375 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1016  23S rRNA methyluridine methyltransferase  44.28 
 
 		 375 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0868  23S rRNA methyluridine methyltransferase  43.58 
 
 		 390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3619  23S rRNA methyluridine methyltransferase  43.58 
 
 		 390 aa  319  7e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3424  23S rRNA methyluridine methyltransferase  43.58 
 
 		 390 aa  319  7e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3496  23S rRNA methyluridine methyltransferase  43.58 
 
 		 390 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3206  23S rRNA methyluridine methyltransferase  44.77 
 
 		 384 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.520782 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0817  23S rRNA methyluridine methyltransferase  44.53 
 
 		 384 aa  316  4e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000520531 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3054  23S rRNA methyluridine methyltransferase  43.45 
 
 		 389 aa  315  7e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14750  23S rRNA methyluridine methyltransferase  46.46 
 
 		 413 aa  314  1.9999999999999998e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.247567 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03620  23S rRNA methyluridine methyltransferase  44.44 
 
 		 388 aa  313  4.999999999999999e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0980  23S rRNA methyluridine methyltransferase  43.07 
 
 		 382 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3309  23S rRNA methyluridine methyltransferase  44.28 
 
 		 384 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0630  23S rRNA methyluridine methyltransferase  43.77 
 
 		 384 aa  311  9e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0801  23S rRNA methyluridine methyltransferase  43.55 
 
 		 379 aa  308  9e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0309  23S rRNA methyluridine methyltransferase  42.82 
 
 		 375 aa  305  1.0000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0579  23S rRNA methyluridine methyltransferase  40.88 
 
 		 377 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3635  23S rRNA methyluridine methyltransferase  42.2 
 
 		 358 aa  296  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21720  23S rRNA methyluridine methyltransferase  48.83 
 
 		 403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  30.88 
 
 		 470 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  31.55 
 
 		 495 aa  159  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  28.47 
 
 		 447 aa  158  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  28.01 
 
 		 572 aa  158  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  30.73 
 
 		 489 aa  150  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1868  RNA methyltransferase, TrmA family  28.92 
 
 		 485 aa  150  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1971  23S rRNA methyltransferase/RumA  28.75 
 
 		 493 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209828  normal  0.0836094 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2309  RNA methyltransferase  28.09 
 
 		 493 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.12141  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  29.29 
 
 		 452 aa  132  9e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  25.3 
 
 		 451 aa  127  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  29.67 
 
 		 468 aa  126  6e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1654  RNA methyltransferase  25.18 
 
 		 554 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000278759  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2258  RNA methyltransferase, TrmA family  25.47 
 
 		 456 aa  119  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0702589  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  30.11 
 
 		 479 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  24.88 
 
 		 459 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1355  RNA methyltransferase  26.59 
 
 		 463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.547923  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  25.18 
 
 		 453 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  23.91 
 
 		 454 aa  117  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  28.78 
 
 		 455 aa  116  8.999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  24.88 
 
 		 457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08576  putative RNA methyltransferase  23.26 
 
 		 470 aa  115  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.695835  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0571  RNA methyltransferase, TrmA family  22.75 
 
 		 473 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0340  RNA methyltransferase  23.97 
 
 		 446 aa  114  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0121257  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  22.59 
 
 		 460 aa  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  22.91 
 
 		 458 aa  113  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  24.75 
 
 		 458 aa  113  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0702  tRNA methyltransferase, TrmA family  25.7 
 
 		 453 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.307327  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2487  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  24.46 
 
 		 513 aa  112  8.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0134453  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  22.63 
 
 		 453 aa  112  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  22.63 
 
 		 453 aa  112  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2518  RNA methyltransferase, TrmA family  26.73 
 
 		 482 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.391256  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3354  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  26.25 
 
 		 443 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0093271  hitchhiker  0.000473524 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  23.43 
 
 		 455 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  26.49 
 
 		 461 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  26.49 
 
 		 461 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3623  RNA methyltransferase, TrmA family  24.94 
 
 		 481 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  22.38 
 
 		 458 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  22.38 
 
 		 458 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  27.04 
 
 		 488 aa  110  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  24.07 
 
 		 470 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  25 
 
 		 468 aa  110  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2249  RNA methyltransferase, TrmA family  24.76 
 
 		 458 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.79134  hitchhiker  0.00749966 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1295  RNA methyltransferase, TrmA family  29.24 
 
 		 436 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0633  RNA methyltransferase  25.42 
 
 		 451 aa  109  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.449857  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  22.74 
 
 		 459 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  22.74 
 
 		 459 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  22.78 
 
 		 459 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  25.59 
 
 		 479 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  23.23 
 
 		 455 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  22.74 
 
 		 459 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  22.74 
 
 		 459 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0406  RNA methyltransferase  24.46 
 
 		 387 aa  109  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.59395  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  22.41 
 
 		 456 aa  108  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>