More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1650 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1650  23S rRNA methyluridine methyltransferase  100 
 
 		 375 aa  779    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.401467 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1568  23S rRNA methyluridine methyltransferase  81.77 
 
 		 376 aa  641    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2640  23S rRNA methyluridine methyltransferase  81.45 
 
 		 376 aa  635    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000831969  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2725  23S rRNA methyluridine methyltransferase  81.45 
 
 		 376 aa  635    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1963  23S rRNA methyluridine methyltransferase  79.14 
 
 		 375 aa  611  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.333439  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1697  23S rRNA methyluridine methyltransferase  79.2 
 
 		 376 aa  613  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00864  23S rRNA m(5)U747-methyltransferase  74.4 
 
 		 375 aa  595  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2783  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumB  74.67 
 
 		 375 aa  594  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.720743  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0962  23S rRNA methyluridine methyltransferase  74.4 
 
 		 375 aa  595  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00870  hypothetical protein  74.4 
 
 		 375 aa  595  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2737  23S rRNA methyluridine methyltransferase  74.4 
 
 		 375 aa  595  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.438081  normal  0.757831 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0931  23S rRNA methyluridine methyltransferase  74.93 
 
 		 375 aa  597  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0887  23S rRNA methyluridine methyltransferase  74.93 
 
 		 375 aa  595  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.848351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1015  23S rRNA methyluridine methyltransferase  75.13 
 
 		 375 aa  594  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2381  23S rRNA methyluridine methyltransferase  76.74 
 
 		 376 aa  592  1e-168  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.624238  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1373  23S rRNA methyluridine methyltransferase  74.67 
 
 		 375 aa  591  1e-168  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2472  23S rRNA methyluridine methyltransferase  73.6 
 
 		 375 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112425  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0987  23S rRNA methyluridine methyltransferase  74.33 
 
 		 375 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0955  23S rRNA methyluridine methyltransferase  74.13 
 
 		 376 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0919  23S rRNA methyluridine methyltransferase  73.8 
 
 		 375 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.983812  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1016  23S rRNA methyluridine methyltransferase  74.06 
 
 		 375 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1035  23S rRNA methyluridine methyltransferase  73.8 
 
 		 375 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3206  23S rRNA methyluridine methyltransferase  53.95 
 
 		 384 aa  425  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.520782 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0980  23S rRNA methyluridine methyltransferase  53.95 
 
 		 382 aa  423  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0817  23S rRNA methyluridine methyltransferase  53.68 
 
 		 384 aa  421  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000520531 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3309  23S rRNA methyluridine methyltransferase  53.68 
 
 		 384 aa  422  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3619  23S rRNA methyluridine methyltransferase  53.42 
 
 		 390 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.934094 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0801  23S rRNA methyluridine methyltransferase  55.32 
 
 		 379 aa  420  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3496  23S rRNA methyluridine methyltransferase  53.42 
 
 		 390 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0579  23S rRNA methyluridine methyltransferase  52.94 
 
 		 377 aa  419  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0868  23S rRNA methyluridine methyltransferase  53.16 
 
 		 390 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3424  23S rRNA methyluridine methyltransferase  53.42 
 
 		 390 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3054  23S rRNA methyluridine methyltransferase  53.3 
 
 		 389 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0309  23S rRNA methyluridine methyltransferase  53.6 
 
 		 375 aa  413  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0630  23S rRNA methyluridine methyltransferase  52.52 
 
 		 384 aa  411  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3635  23S rRNA methyluridine methyltransferase  55.81 
 
 		 358 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1713  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumB  52.12 
 
 		 379 aa  395  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1142  23S rRNA methyluridine methyltransferase  49.73 
 
 		 375 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000767516 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1285  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumB  49.6 
 
 		 374 aa  377  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00745486  normal  0.0225207 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3753  23S rRNA methyluridine methyltransferase  50.26 
 
 		 379 aa  368  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3299  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumB  47.33 
 
 		 411 aa  359  5e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2390  23S rRNA methyluridine methyltransferase  48.03 
 
 		 382 aa  356  3.9999999999999996e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.437044 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4319  23S rRNA methyluridine methyltransferase  49.07 
 
 		 372 aa  352  5.9999999999999994e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.255085 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1448  23S rRNA methyluridine methyltransferase  49.34 
 
 		 376 aa  350  2e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.305727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03620  23S rRNA methyluridine methyltransferase  41.28 
 
 		 388 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14750  23S rRNA methyluridine methyltransferase  42.09 
 
 		 413 aa  276  4e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.247567 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21720  23S rRNA methyluridine methyltransferase  44.17 
 
 		 403 aa  255  9e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1971  23S rRNA methyltransferase/RumA  30.47 
 
 		 493 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.209828  normal  0.0836094 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1868  RNA methyltransferase, TrmA family  30.23 
 
 		 485 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  30.32 
 
 		 489 aa  177  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1452  RNA methyltransferase  31.41 
 
 		 495 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  28.91 
 
 		 470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  25.64 
 
 		 460 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  25.77 
 
 		 458 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  25.77 
 
 		 458 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  24.61 
 
 		 459 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  24.81 
 
 		 459 aa  161  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  24.61 
 
 		 459 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  24.81 
 
 		 458 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  25.52 
 
 		 458 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  25.52 
 
 		 458 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  24.61 
 
 		 459 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  24.61 
 
 		 459 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  25.52 
 
 		 458 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  24.61 
 
 		 459 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  24.61 
 
 		 459 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  25.77 
 
 		 454 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  25.52 
 
 		 454 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  25.39 
 
 		 458 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  25.85 
 
 		 458 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  27.3 
 
 		 460 aa  156  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  24.21 
 
 		 459 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  24.21 
 
 		 459 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  25.39 
 
 		 458 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  26.95 
 
 		 572 aa  155  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2309  RNA methyltransferase  27.6 
 
 		 493 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.12141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  23.95 
 
 		 459 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  26.2 
 
 		 447 aa  153  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  26.26 
 
 		 457 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2695  RNA methyltransferase  29.06 
 
 		 457 aa  150  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3634  23S rRNA methyltransferase/RumA  27.39 
 
 		 460 aa  149  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.226718 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  25.52 
 
 		 459 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  28.57 
 
 		 466 aa  147  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  25.65 
 
 		 468 aa  146  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  27.25 
 
 		 468 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  27.23 
 
 		 452 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4122  RNA methyltransferase, TrmA family  27.72 
 
 		 461 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4083  RNA methyltransferase, TrmA family  27.72 
 
 		 461 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05160  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  27.84 
 
 		 401 aa  145  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.368035  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3654  TrmA family RNA methyltransferase  25.53 
 
 		 455 aa  145  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.412422  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0340  RNA methyltransferase  24.66 
 
 		 446 aa  145  2e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0121257  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0862  RNA methyltransferase, TrmA family  27.55 
 
 		 472 aa  143  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  24.48 
 
 		 456 aa  142  8e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2558  RNA methyltransferase, TrmA family  27.64 
 
 		 480 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1654  RNA methyltransferase  25.74 
 
 		 554 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000278759  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  27.32 
 
 		 479 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  28.12 
 
 		 455 aa  139  8.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1688  RNA methyltransferase, TrmA family  26.6 
 
 		 476 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2487  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  25.58 
 
 		 513 aa  138  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0134453  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3305  RNA methyltransferase, TrmA family  26.82 
 
 		 460 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>