More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4302 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4302  indole-3-glycerol-phosphate synthase  100 
 
 
283 aa  560  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.62403  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1560  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.4 
 
 
280 aa  228  9e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.627626  normal  0.76351 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1153  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.02 
 
 
281 aa  209  4e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000666222 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2380  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.85 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.446118  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2494  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.93 
 
 
266 aa  162  6e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141997  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0711  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.98 
 
 
267 aa  158  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1734  indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.54 
 
 
268 aa  155  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2259  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.08 
 
 
266 aa  152  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1254  Indole-3-glycerol phosphate synthase  39.39 
 
 
259 aa  151  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.54 
 
 
266 aa  151  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2497  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.9 
 
 
271 aa  150  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0317819  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1957  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.33 
 
 
266 aa  149  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2079  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.13 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2195  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.68 
 
 
273 aa  146  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3582  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  41.31 
 
 
263 aa  145  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.433048  normal  0.034535 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0160  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.43 
 
 
264 aa  144  1e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.286588  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2358  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.65 
 
 
268 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0182  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.05 
 
 
264 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0756  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.11 
 
 
266 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4451  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.26 
 
 
264 aa  142  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0983396  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3801  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.75 
 
 
295 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1529  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.72 
 
 
294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.260745  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2798  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.38 
 
 
265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.822714  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5212  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  39.51 
 
 
285 aa  139  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1822  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38 
 
 
270 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025467 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2048  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.11 
 
 
266 aa  139  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3236  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.27 
 
 
265 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0100  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  33.82 
 
 
294 aa  137  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3601  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.77 
 
 
264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147374  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13441  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.09 
 
 
295 aa  135  7.000000000000001e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.847237  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3649  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.62 
 
 
263 aa  135  7.000000000000001e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5135  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.27 
 
 
285 aa  135  9e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0596485 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0269  indole-3-glycerol-phosphate synthase  33.84 
 
 
268 aa  135  9e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000502728  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4672  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.27 
 
 
285 aa  135  9e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1926  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.47 
 
 
296 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1339  indole-3-glycerol phosphate synthase  37.86 
 
 
259 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.419917  normal  0.796071 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5394  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.32 
 
 
285 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.467387  normal  0.310018 
 
 
-
 
NC_002936  DET1484  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.77 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0606  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.16 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.64209  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2798  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.8 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.812151  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2567  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.14 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0720427  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1436  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.16 
 
 
258 aa  133  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.567597  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1274  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.63 
 
 
259 aa  133  3e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1251  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.71 
 
 
270 aa  133  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2778  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.11 
 
 
262 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000331448  hitchhiker  0.0000255859 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0519  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.68 
 
 
258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1141  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.92 
 
 
268 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1399  indole-3-glycerol phosphate synthase  38.25 
 
 
268 aa  133  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.105391  hitchhiker  0.00077331 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3718  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.52 
 
 
264 aa  133  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0881817  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2966  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.86 
 
 
274 aa  132  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1232  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.1 
 
 
270 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0182595  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2139  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.4 
 
 
263 aa  132  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.248459  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1866  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.29 
 
 
260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46110  indole-3-glycerol-phosphate synthase  33.71 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3017  indole-3-glycerol-phosphate synthase  44.27 
 
 
317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0754  indole-3-glycerol phosphate synthase  33.59 
 
 
265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.297551 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4375  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.25 
 
 
263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.893043  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3460  indole-3-glycerol phosphate synthase  34.98 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.860463  normal  0.18397 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1100  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.52 
 
 
268 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1650  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.11 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2048  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.61 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0288886  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1639  indole-3-glycerol phosphate synthase  34.12 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189756  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1838  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.39 
 
 
264 aa  130  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0870  indole-3-glycerol-phosphate synthase  33.71 
 
 
295 aa  130  3e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.474663  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0731  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.38 
 
 
263 aa  130  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.374579  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3173  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.68 
 
 
265 aa  130  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.568636 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0586  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.61 
 
 
266 aa  130  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3621  indole-3-glycerol phosphate synthase  38.39 
 
 
268 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5576  Indole-3-glycerol phosphate synthase  33.33 
 
 
288 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513944  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2247  indole-3-glycerol phosphate synthase  34.36 
 
 
267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.835264  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1159  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.68 
 
 
266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0503  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.52 
 
 
276 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2465  indole-3-glycerol phosphate synthase  35.97 
 
 
271 aa  129  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2017  indole-3-glycerol-phosphate synthase  35.91 
 
 
270 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00220799  normal  0.525687 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1416  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.7 
 
 
278 aa  129  7.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3520  indole-3-glycerol-phosphate synthase  31.2 
 
 
270 aa  128  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2843  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.36 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00184612  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3242  indole-3-glycerol phosphate synthase  34.36 
 
 
263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.857016  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3489  indole-3-glycerol-phosphate synthase  31.75 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3027  indole-3-glycerol phosphate synthase  40.64 
 
 
260 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2829  indole-3-glycerol-phosphate synthase  36.11 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.232078  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0640  indole-3-glycerol-phosphate synthase  33.6 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3099  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.98 
 
 
295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2274  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.51 
 
 
288 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1197  indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.66 
 
 
295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.075446  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1215  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.45 
 
 
271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.783684  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2627  indole-3-glycerol-phosphate synthase  31.39 
 
 
293 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236975  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12880  indole-3-glycerol phosphate synthase  39.42 
 
 
273 aa  125  6e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.315308  normal  0.0294244 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04004  indole-3-glycerol-phosphate synthase  33.59 
 
 
265 aa  125  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1931  indole-3-glycerol-phosphate synthase  43.22 
 
 
268 aa  125  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.535725 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0579  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.34 
 
 
266 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0370  indole-3-glycerol-phosphate synthase  37.26 
 
 
266 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3026  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.82 
 
 
267 aa  125  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114163  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3169  indole-3-glycerol phosphate synthase  31.05 
 
 
297 aa  125  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.119969 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1063  indole-3-glycerol-phosphate synthase  33.21 
 
 
271 aa  124  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.493253  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1877  indole-3-glycerol phosphate synthase  33.6 
 
 
266 aa  125  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.597244  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0872  indole-3-glycerol-phosphate synthase  33.46 
 
 
260 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.169431  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1047  Indole-3-glycerol-phosphate synthase  38.86 
 
 
273 aa  124  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08360  indole-3-glycerol-phosphate synthase  34.73 
 
 
278 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000387982 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2332  indole-3-glycerol phosphate synthase  34.46 
 
 
268 aa  124  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>