More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3602 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3602  5'-3' exonuclease  100 
 
 		 299 aa  600  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  45.45 
 
 		 979 aa  272  6e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  44.07 
 
 		 928 aa  251  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7357  DNA polymerase I  45.3 
 
 		 1020 aa  250  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0299  DNA polymerase I  44.22 
 
 		 992 aa  250  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0848  DNA polymerase I  43.9 
 
 		 1032 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0453  DNA polymerase I  44.06 
 
 		 1014 aa  247  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0956  DNA polymerase I  43.9 
 
 		 1033 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0357  DNA polymerase I  44.06 
 
 		 1010 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5204  DNA polymerase I  42.66 
 
 		 1025 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4857  DNA polymerase I  43.21 
 
 		 1021 aa  240  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.450809 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3381  DNA polymerase I  43.77 
 
 		 1004 aa  240  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3945  DNA polymerase I  42.52 
 
 		 978 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  41.22 
 
 		 976 aa  237  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1853  DNA polymerase I  43.75 
 
 		 940 aa  236  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0210712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  40.88 
 
 		 978 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0221  DNA polymerase I  41.36 
 
 		 973 aa  233  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.324106 
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  40.54 
 
 		 979 aa  233  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3514  DNA polymerase A  44.98 
 
 		 924 aa  231  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  41.5 
 
 		 968 aa  229  6e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0200  DNA polymerase I  42.16 
 
 		 937 aa  228  8e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  42.16 
 
 		 892 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4103  DNA polymerase I  41.16 
 
 		 999 aa  225  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  41.81 
 
 		 937 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1028  DNA polymerase I  41.81 
 
 		 937 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447207  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4423  DNA polymerase I  40.48 
 
 		 1016 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1683  DNA polymerase I  40.48 
 
 		 929 aa  222  4.9999999999999996e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.569036  normal  0.718828 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  41.24 
 
 		 893 aa  222  7e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2377  DNA polymerase I  41.37 
 
 		 1000 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  41.98 
 
 		 888 aa  220  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2909  DNA polymerase I  41.26 
 
 		 932 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.033314  normal  0.843304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0678  DNA polymerase I  40.97 
 
 		 1016 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80797  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2864  DNA polymerase I  43.26 
 
 		 480 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  40.21 
 
 		 935 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  39.37 
 
 		 892 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1501  DNA polymerase I  40.65 
 
 		 1024 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2471  DNA polymerase I  39.48 
 
 		 1047 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2694  DNA polymerase I  39.48 
 
 		 1047 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2846  DNA polymerase I  41.67 
 
 		 943 aa  212  7e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.411951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  40.97 
 
 		 892 aa  209  5e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  38.68 
 
 		 892 aa  208  8e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1391  DNA polymerase I  41.16 
 
 		 1013 aa  208  1e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.413806 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2399  DNA polymerase I  38.83 
 
 		 1047 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.245921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2744  DNA polymerase I  39.05 
 
 		 1043 aa  207  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.560241 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1504  DNA polymerase I  43.85 
 
 		 915 aa  204  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0450  DNA polymerase I  38.44 
 
 		 941 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1220  ribonuclease H  42.27 
 
 		 484 aa  202  7e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  39.52 
 
 		 891 aa  201  9e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3536  DNA polymerase I  39.48 
 
 		 1060 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0949  ribonuclease H  44.49 
 
 		 482 aa  199  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0278  DNA polymerase I  40.89 
 
 		 945 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0048  DNA polymerase I  36.27 
 
 		 861 aa  193  2e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  40.21 
 
 		 926 aa  192  5e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0825  5'-3' exonuclease  40.21 
 
 		 474 aa  192  7e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0774  ribonuclease H  40.91 
 
 		 474 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.245945  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0625  DNA polymerase I  39.52 
 
 		 937 aa  191  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.480617 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  39.37 
 
 		 906 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  36.9 
 
 		 891 aa  186  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  40.27 
 
 		 897 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0102  DNA polymerase I  40.15 
 
 		 918 aa  186  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758898  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  38.62 
 
 		 895 aa  186  6e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  40.53 
 
 		 945 aa  186  6e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  37.63 
 
 		 928 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  39.77 
 
 		 933 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  38.08 
 
 		 911 aa  184  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  36.59 
 
 		 928 aa  182  7e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  39.18 
 
 		 884 aa  181  9.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1003  DNA polymerase I  36.2 
 
 		 858 aa  181  1e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.842634  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  37.54 
 
 		 902 aa  180  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17228  predicted protein  37.29 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  38.91 
 
 		 897 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  39.77 
 
 		 921 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1494  5'-3' exonuclease  34.63 
 
 		 299 aa  179  4e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.32691  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  36.71 
 
 		 930 aa  179  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  39.77 
 
 		 921 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  39.77 
 
 		 935 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  38.27 
 
 		 930 aa  179  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  39.77 
 
 		 921 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  43.05 
 
 		 902 aa  179  4.999999999999999e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  36.01 
 
 		 928 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  35.34 
 
 		 928 aa  179  7e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  35.34 
 
 		 928 aa  179  7e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  35.34 
 
 		 928 aa  179  7e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  35.34 
 
 		 928 aa  179  7e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  35.34 
 
 		 928 aa  179  7e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  35.34 
 
 		 928 aa  179  7e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  35.34 
 
 		 928 aa  179  7e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  35.34 
 
 		 928 aa  178  8e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  35.48 
 
 		 939 aa  178  9e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4669  DNA polymerase I  39.39 
 
 		 922 aa  177  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  35.66 
 
 		 928 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  37.42 
 
 		 922 aa  178  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  35.66 
 
 		 928 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  39.02 
 
 		 921 aa  178  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  36.4 
 
 		 912 aa  177  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  35.66 
 
 		 928 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  38.73 
 
 		 915 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  35.66 
 
 		 928 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  35.34 
 
 		 928 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  38.64 
 
 		 939 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>