135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1432 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1432  dimethylmenaquinone methyltransferase  100 
 
 		 103 aa  209  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8321  hypothetical protein  60.82 
 
 		 224 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242879  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4138  hypothetical protein  59.79 
 
 		 224 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2713  hypothetical protein  61.46 
 
 		 225 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5620  hypothetical protein  58.76 
 
 		 224 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7077  hypothetical protein  59.41 
 
 		 224 aa  124  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4429  hypothetical protein  61.76 
 
 		 224 aa  122  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.414912  normal  0.436944 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3165  hypothetical protein  54.55 
 
 		 225 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.25915  normal  0.552325 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6359  hypothetical protein  49.47 
 
 		 223 aa  99.4  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2315  hypothetical protein  51.04 
 
 		 222 aa  94.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612121  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05389  hypothetical protein  48.08 
 
 		 224 aa  91.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.969658 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2302  Dimethylmenaquinone methyltransferase  45.36 
 
 		 225 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04570  Dimethylmenaquinone methyltransferase  43.96 
 
 		 231 aa  90.9  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5797  dimethylmenaquinone methyltransferase  52.13 
 
 		 225 aa  87.4  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121139 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2726  dimethylmenaquinone methyltransferase  45.65 
 
 		 233 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305233  normal  0.0255457 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0889  Dimethylmenaquinone methyltransferase  43.75 
 
 		 223 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6118  hypothetical protein  48.35 
 
 		 222 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8625  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.58 
 
 		 236 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.422142  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0718  dimethylmenaquinone methyltransferase  45.1 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.287716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3078  hypothetical protein  45.45 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.177547  normal  0.0349255 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2380  Dimethylmenaquinone methyltransferase  44.09 
 
 		 225 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4233  Dimethylmenaquinone methyltransferase  41.67 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.95661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3549  dimethylmenaquinone methyltransferase  42.7 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0526582 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6784  hypothetical protein  43.02 
 
 		 213 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3988  dimethylmenaquinone methyltransferase  43.75 
 
 		 231 aa  74.3  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34613  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1131  Dimethylmenaquinone methyltransferase  48.65 
 
 		 450 aa  72.8  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5904  dimethylmenaquinone methyltransferase  40.45 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.314397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1382  dimethylmenaquinone methyltransferase  46.24 
 
 		 231 aa  72  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38400  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase  41.49 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1611  hypothetical protein  38.3 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.642734  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3330  Dimethylmenaquinone methyltransferase  42.86 
 
 		 187 aa  67.4  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00629512  hitchhiker  0.00927327 
 
 
-
 
NC_003296  RS03175  putative transferase protein  38.54 
 
 		 216 aa  67  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.191246 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3787  Dimethylmenaquinone methyltransferase  48.96 
 
 		 227 aa  67  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.924473  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0823  Dimethylmenaquinone methyltransferase  42.86 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2091  hypothetical protein  38.1 
 
 		 237 aa  61.2  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3070  dimethylmenaquinone methyltransferase  41.77 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4165  Dimethylmenaquinone methyltransferase  43.42 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777049  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0600  dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.200875  normal  0.605092 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5585  Dimethylmenaquinone methyltransferase  31.25 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246654  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5742  4-carboxy-4-hydroxy-2-oxoadipate aldolase/oxaloacetate decarboxylase  39.53 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228064  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0093  hypothetical protein  36.9 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0092  hypothetical protein  36.9 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4121  hypothetical protein  36.9 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4616  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.58 
 
 		 232 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.610744  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1057  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.52 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0516  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  41.03 
 
 		 438 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4448  hypothetical protein  43.02 
 
 		 227 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100533  normal  0.0876341 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5772  dimethylmenaquinone methyltransferase  40 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0337  hypothetical protein  37.78 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3633  hypothetical protein  36.05 
 
 		 231 aa  57  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.715784 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2817  hypothetical protein  39.51 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00663011  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0455  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  36.59 
 
 		 428 aa  56.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6375  Dimethylmenaquinone methyltransferase  32.04 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.830889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0321  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  39.74 
 
 		 438 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1403  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  41.03 
 
 		 438 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.175956  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0095  Dimethylmenaquinone methyltransferase  48.98 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3890  hypothetical protein  37.66 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5802  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.5 
 
 		 229 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.965352  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2247  demethylmenaquinone methyltransferase-like  32.93 
 
 		 439 aa  53.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.201422  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5464  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.5 
 
 		 232 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7652  demethylmenaquinone methyltransferase  33.98 
 
 		 224 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5398  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.5 
 
 		 232 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00314819 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3207  hypothetical protein  41.86 
 
 		 234 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39280  predicted protein  34.94 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.632179 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4277  dimethylmenaquinone methyltransferase  41.67 
 
 		 228 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.126556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6027  dimethylmenaquinone methyltransferase  37.5 
 
 		 232 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.644055  normal  0.152759 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4544  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.01 
 
 		 224 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0521479 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0582  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  35.9 
 
 		 437 aa  52  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.062003  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2121  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.33 
 
 		 428 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2031  hypothetical protein  33.72 
 
 		 229 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  normal  0.731044 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3877  Dimethylmenaquinone methyltransferase  39.51 
 
 		 224 aa  51.2  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44651  predicted protein  45.61 
 
 		 281 aa  51.2  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1170  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  33.77 
 
 		 413 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0707  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  35.63 
 
 		 428 aa  51.2  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172064 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7569  hypothetical protein  39.78 
 
 		 227 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0767982  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2429  putative dimethylmenaquinone methyltransferase  34.15 
 
 		 235 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2390  putative methyltransferase  36.07 
 
 		 221 aa  50.4  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4706  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.46 
 
 		 232 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3497  hypothetical protein  41.57 
 
 		 215 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00582186 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4872  dimethylmenaquinone methyltransferase  36.46 
 
 		 232 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1367  hypothetical protein  47.17 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.797673 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6038  hypothetical protein  38.71 
 
 		 227 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0432117  normal  0.335015 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0461  Dimethylmenaquinone methyltransferase  29.59 
 
 		 231 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3360  hypothetical protein  30.95 
 
 		 227 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3204  hypothetical protein  41.38 
 
 		 237 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0457  Orotidine 5'-phosphate decarboxylase  32.93 
 
 		 426 aa  48.9  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1453  bifunctional hexulose-6-phosphate synthase/ribonuclease regulator  34.21 
 
 		 427 aa  48.5  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.395706 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4096  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.5 
 
 		 232 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.189235 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3983  Dimethylmenaquinone methyltransferase  37.5 
 
 		 232 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2988  hypothetical protein  43.4 
 
 		 212 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5092  dimethylmenaquinone methyltransferase  39.19 
 
 		 215 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2644  hypothetical protein  33.78 
 
 		 529 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.452342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4150  dimethylmenaquinone methyltransferase  34.38 
 
 		 221 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.99818  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2615  hypothetical protein  33.78 
 
 		 509 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2659  hypothetical protein  33.78 
 
 		 509 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0329856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2698  hypothetical protein  38.89 
 
 		 227 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.275881  normal  0.549392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1224  Dimethylmenaquinone methyltransferase  34.18 
 
 		 226 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4321  hypothetical protein  33.33 
 
 		 227 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.524668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9409  dimethylmenaquinone methyltransferase  29.87 
 
 		 204 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5818  Dimethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 205 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.95078  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>