More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_p840_55 on replicon NC_011311
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011311  VSAL_p840_55  putative beta-N-acetylhexosaminidase precursor  100 
 
 		 729 aa  1458    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000000313171  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  30.34 
 
 		 604 aa  101  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0281  beta-hexosaminidase  29.54 
 
 		 360 aa  98.2  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.929457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2154  beta-hexosaminidase  28.32 
 
 		 356 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.659328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25195  beta-hexosaminidase  27.92 
 
 		 332 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3870  beta-hexosaminidase  28.98 
 
 		 336 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2145  beta-hexosaminidase  29.08 
 
 		 336 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0879148 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10240  lipoprotein lpqI  26.41 
 
 		 388 aa  96.3  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000940475  normal  0.839336 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3261  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.48 
 
 		 369 aa  95.9  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0432032 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2614  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.48 
 
 		 369 aa  95.9  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1662  beta-hexosaminidase  28.63 
 
 		 336 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370939  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3281  beta-hexosaminidase  28.57 
 
 		 336 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2346  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.18 
 
 		 361 aa  95.5  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3630  glycoside hydrolase family protein  27.06 
 
 		 352 aa  95.1  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1686  beta-hexosaminidase  28.99 
 
 		 336 aa  95.1  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.737297  normal  0.0730175 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3507  beta-hexosaminidase  28.22 
 
 		 336 aa  94.4  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0308  beta-hexosaminidase  28.11 
 
 		 360 aa  94  9e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.446956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3597  beta-hexosaminidase  28.37 
 
 		 336 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.656661  normal  0.548595 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  30.45 
 
 		 444 aa  93.2  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5256  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.15 
 
 		 363 aa  92.8  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.973302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1590  beta-hexosaminidase  28.01 
 
 		 336 aa  92  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.800701 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  26.17 
 
 		 520 aa  90.5  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  25.69 
 
 		 426 aa  90.1  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0484  glycoside hydrolase family 3 protein  25.44 
 
 		 528 aa  89.4  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.299278  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3056  glycoside hydrolase family 3 protein  26.07 
 
 		 352 aa  89  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  24.29 
 
 		 517 aa  87.8  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1179  beta-hexosaminidase  29.04 
 
 		 313 aa  87.4  8e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00210954  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0415  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.86 
 
 		 328 aa  86.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0694223 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0340  putative beta-glucosidase  27.94 
 
 		 538 aa  85.9  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0256  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.73 
 
 		 400 aa  86.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0702378 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2837  beta-hexosaminidase  29.14 
 
 		 333 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0312091  hitchhiker  0.000147131 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0853  beta-hexosaminidase  29.04 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457661  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.05 
 
 		 511 aa  85.5  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1754  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.27 
 
 		 364 aa  85.9  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0314  beta-hexosaminidase  27.34 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000877507  hitchhiker  0.00197182 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14540  beta-hexosaminidase  25.4 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.79 
 
 		 398 aa  84  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2067  glycoside hydrolase family protein  26.39 
 
 		 340 aa  83.6  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.268597  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.51 
 
 		 537 aa  82.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0219  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.19 
 
 		 397 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0229  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.19 
 
 		 401 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0813841  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  25.07 
 
 		 386 aa  83.2  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1243  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.77 
 
 		 347 aa  82.8  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0239  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.19 
 
 		 401 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.716439 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0423  glycoside hydrolase family 3 domain protein  24.44 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.14537  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.11 
 
 		 596 aa  82  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1790  glycosyl hydrolase  25.44 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0298414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1631  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.84 
 
 		 364 aa  81.6  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  27.52 
 
 		 575 aa  81.3  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1987  glycoside hydrolase family 3 protein  27.36 
 
 		 337 aa  81.3  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.564603  normal  0.428635 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.94 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  27.44 
 
 		 575 aa  81.3  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.49 
 
 		 543 aa  80.9  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2183  glycoside hydrolase family protein  27.4 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2401  beta-hexosaminidase  26.65 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000799068  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.28 
 
 		 534 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.28 
 
 		 534 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  30.13 
 
 		 538 aa  79.7  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1945  beta-hexosaminidase  28.29 
 
 		 337 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2894  beta-hexosaminidase  27.66 
 
 		 342 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.0758601 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1200  holo-acyl-carrier-protein synthase  25 
 
 		 543 aa  79  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.174413  decreased coverage  0.00601757 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2523  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.09 
 
 		 337 aa  79  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  27.96 
 
 		 542 aa  78.6  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  23.89 
 
 		 543 aa  78.2  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0655  glycosy hydrolase family protein  27.21 
 
 		 347 aa  78.2  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448002  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1261  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.26 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  26.93 
 
 		 971 aa  77  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0835  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.28 
 
 		 586 aa  76.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0311157 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.72 
 
 		 698 aa  77.4  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  26.17 
 
 		 656 aa  77  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  23.48 
 
 		 528 aa  76.6  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1592  beta-hexosaminidase  26.56 
 
 		 343 aa  75.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.541862  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1296  glycoside hydrolase family protein  25.16 
 
 		 357 aa  76.3  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  26.74 
 
 		 543 aa  76.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1700  beta-hexosaminidase  26.56 
 
 		 343 aa  75.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  27.62 
 
 		 1007 aa  76.3  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  28.15 
 
 		 618 aa  75.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.24 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1924  beta-hexosaminidase  26.49 
 
 		 339 aa  75.5  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.807084  hitchhiker  0.0000306127 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1754  beta-N-acetylhexosaminidase  25 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0295  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.41 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2818  beta-hexosaminidase  26.56 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.743458  normal  0.716469 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1090  beta-hexosaminidase  27.27 
 
 		 342 aa  74.3  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1606  beta-hexosaminidase  24.36 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.632419  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  24.93 
 
 		 511 aa  73.6  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25420  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  22.6 
 
 		 519 aa  73.6  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.128783  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1509  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.96 
 
 		 338 aa  73.6  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  26.99 
 
 		 990 aa  73.2  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  23.65 
 
 		 365 aa  73.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1132  beta-hexosaminidase  25.73 
 
 		 351 aa  73.6  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00323913  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4322  putative Beta-hexosaminidase  24.38 
 
 		 476 aa  73.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.127427  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  25.32 
 
 		 420 aa  73.9  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  23.65 
 
 		 365 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1622  beta-hexosaminidase  24.76 
 
 		 337 aa  73.6  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.2238  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  23.75 
 
 		 1003 aa  72.8  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1318  putative glycosyl hydrolase  24.48 
 
 		 382 aa  72.8  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  24.1 
 
 		 365 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1019  beta-hexosaminidase  28.34 
 
 		 342 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1015  beta-hexosaminidase  26.35 
 
 		 342 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.791894  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1637  beta-hexosaminidase  23.23 
 
 		 365 aa  72.8  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0105017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>