63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03138 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03138  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  764    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002838  hypothetical protein  71.94 
 
 		 359 aa  479  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1648  hypothetical protein  52.61 
 
 		 338 aa  354  2e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2284  cheW-like protein  45.11 
 
 		 363 aa  278  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1306  CheW protein  44.29 
 
 		 335 aa  189  8e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.975654 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1461  CheW protein  49.73 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2912  putative CheW protein  52.12 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.696236  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1366  CheW protein  46.12 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898971 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3203  CheW domain-containing protein  45.02 
 
 		 326 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3044  putative CheW protein  50.27 
 
 		 336 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.630998 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2902  putative CheW protein  49.73 
 
 		 336 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.144526  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3042  CheW protein  42.86 
 
 		 377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1350  CheW-like protein  49.71 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1373  CheW protein  45.21 
 
 		 335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.171778 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1390  CheW protein  40 
 
 		 329 aa  182  6e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.180967 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2552  putative CheW protein  49.7 
 
 		 330 aa  182  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02864  CheW protein  46.63 
 
 		 271 aa  182  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1642  CheW protein  46.81 
 
 		 338 aa  178  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.991032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2273  CheW domain-containing protein  39.08 
 
 		 359 aa  177  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.607284  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1206  CheW protein  48.48 
 
 		 360 aa  173  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.750839  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1385  CheW protein  40.52 
 
 		 305 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1527  cheW-like domain-containing protein  49.66 
 
 		 238 aa  166  8e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.54686  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3024  CheW protein  46.21 
 
 		 287 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1534  putative CheW protein  45.71 
 
 		 298 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.357648 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4333  CheW domain-containing protein  45.71 
 
 		 298 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3902  CheW protein  45.71 
 
 		 296 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1571  CheW protein  44.76 
 
 		 317 aa  133  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.99203  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3659  CheW protein  44.22 
 
 		 291 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3863  hypothetical protein  45.58 
 
 		 296 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.715886  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45510  CheW domain-containing protein  45.58 
 
 		 296 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1967  CheW domain-containing protein  45.59 
 
 		 260 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3429  CheW-like protein  44.22 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.730107 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2797  putative CheW protein  45.71 
 
 		 265 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.198495  normal  0.208066 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1987  CheW domain protein  44.9 
 
 		 295 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.998121  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3420  CheW domain-containing protein  39.01 
 
 		 320 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2156  flagellar hook-basal body complex protein FliE  29.75 
 
 		 385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1346  CheW protein  39.57 
 
 		 247 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.22411  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0471  putative CheW protein  35.46 
 
 		 316 aa  94.4  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.404706  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0991  CheW protein  38.19 
 
 		 290 aa  90.5  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0500652  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1183  CheW domain protein  30.41 
 
 		 243 aa  75.5  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.14971 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  38.96 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  39.24 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  35.09 
 
 		 539 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  37.66 
 
 		 489 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  48.21 
 
 		 926 aa  51.2  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  57.97 
 
 		 268 aa  48.9  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  45 
 
 		 630 aa  48.5  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  28.71 
 
 		 1281 aa  47.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  44.23 
 
 		 1261 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1434  hypothetical protein  27.69 
 
 		 772 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.709183  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0436  hypothetical protein  56.25 
 
 		 613 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4621  hypothetical protein  32.89 
 
 		 481 aa  45.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.957856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1394  putative polyketide synthase PksL  41.07 
 
 		 5993 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1631  sporulation domain-containing protein  37.61 
 
 		 525 aa  44.3  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0459  hypothetical protein  56.86 
 
 		 611 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0872017  normal  0.526818 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2373  hypothetical protein  29.03 
 
 		 480 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.022356 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  50.98 
 
 		 501 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0449  hypothetical protein  56.86 
 
 		 611 aa  43.9  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00263959  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  43.48 
 
 		 7149 aa  43.5  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  51.06 
 
 		 344 aa  43.5  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1988  group-specific protein  29.17 
 
 		 928 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 333 aa  43.1  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1929  type II and III secretion system protein  30.12 
 
 		 796 aa  43.1  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.114575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>