50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1967 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1967  CheW domain-containing protein  100 
 
 
260 aa  520  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2797  putative CheW protein  42.59 
 
 
265 aa  182  3e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.198495  normal  0.208066 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45510  CheW domain-containing protein  53.1 
 
 
296 aa  168  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1571  CheW protein  45.86 
 
 
317 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.99203  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3420  CheW domain-containing protein  51.77 
 
 
320 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4333  CheW domain-containing protein  45.41 
 
 
298 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3659  CheW protein  37.32 
 
 
291 aa  165  8e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3863  hypothetical protein  37.54 
 
 
296 aa  165  8e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.715886  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3429  CheW-like protein  38.41 
 
 
300 aa  165  8e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.730107 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1534  putative CheW protein  46.59 
 
 
298 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.357648 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3902  CheW protein  37.72 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1987  CheW domain protein  51.03 
 
 
295 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.998121  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1346  CheW protein  40.57 
 
 
247 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.22411  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2156  flagellar hook-basal body complex protein FliE  45.14 
 
 
385 aa  146  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1390  CheW protein  33.2 
 
 
329 aa  140  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.180967 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02864  CheW protein  45.71 
 
 
271 aa  139  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002838  hypothetical protein  39.79 
 
 
359 aa  138  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2273  CheW domain-containing protein  39.32 
 
 
359 aa  138  7e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.607284  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1642  CheW protein  36.04 
 
 
338 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.991032  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2284  cheW-like protein  41.29 
 
 
363 aa  136  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3042  CheW protein  36.36 
 
 
377 aa  136  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03138  hypothetical protein  45.59 
 
 
389 aa  133  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3024  CheW protein  38.79 
 
 
287 aa  133  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1527  cheW-like domain-containing protein  38.75 
 
 
238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.54686  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3203  CheW domain-containing protein  36.41 
 
 
326 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1385  CheW protein  32.76 
 
 
305 aa  131  9e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1648  hypothetical protein  36.11 
 
 
338 aa  129  6e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2552  putative CheW protein  32.73 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1306  CheW protein  34.39 
 
 
335 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.975654 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2902  putative CheW protein  30.95 
 
 
336 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.144526  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1366  CheW protein  34.41 
 
 
335 aa  127  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898971 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1373  CheW protein  34.41 
 
 
335 aa  126  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.171778 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3044  putative CheW protein  31.3 
 
 
336 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.630998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2912  putative CheW protein  31.71 
 
 
336 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.696236  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1461  CheW protein  38.57 
 
 
331 aa  125  9e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1206  CheW protein  40.71 
 
 
360 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.750839  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1350  CheW-like protein  37.91 
 
 
343 aa  124  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0991  CheW protein  42.28 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0500652  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0471  putative CheW protein  40.49 
 
 
316 aa  109  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.404706  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  36 
 
 
159 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  37.33 
 
 
159 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  36 
 
 
159 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  36 
 
 
159 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  36 
 
 
159 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  37.33 
 
 
159 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  36 
 
 
159 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  35.06 
 
 
161 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  29.2 
 
 
161 aa  43.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  36 
 
 
159 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  36 
 
 
159 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>