42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2273 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2273  CheW domain-containing protein  100 
 
 		 359 aa  730    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.607284  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2552  putative CheW protein  54.52 
 
 		 330 aa  352  7e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3203  CheW domain-containing protein  55.22 
 
 		 326 aa  351  1e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1306  CheW protein  54.59 
 
 		 335 aa  348  7e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.975654 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1390  CheW protein  53.19 
 
 		 329 aa  348  1e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.180967 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1366  CheW protein  54.77 
 
 		 335 aa  345  7e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898971 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1373  CheW protein  52.83 
 
 		 335 aa  344  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.171778 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2912  putative CheW protein  53.97 
 
 		 336 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.696236  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3044  putative CheW protein  54.25 
 
 		 336 aa  338  7e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.630998 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2902  putative CheW protein  54.35 
 
 		 336 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.144526  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1461  CheW protein  53.97 
 
 		 331 aa  336  5e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3042  CheW protein  46.56 
 
 		 377 aa  326  3e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1642  CheW protein  50.55 
 
 		 338 aa  323  4e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.991032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1350  CheW-like protein  49.19 
 
 		 343 aa  320  3e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1206  CheW protein  46.15 
 
 		 360 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.750839  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1385  CheW protein  42.09 
 
 		 305 aa  265  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02864  CheW protein  48.54 
 
 		 271 aa  217  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2284  cheW-like protein  50.29 
 
 		 363 aa  199  5e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1527  cheW-like domain-containing protein  41.7 
 
 		 238 aa  190  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.54686  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1648  hypothetical protein  34.08 
 
 		 338 aa  187  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002838  hypothetical protein  46.93 
 
 		 359 aa  179  7e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3024  CheW protein  49.31 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03138  hypothetical protein  52.08 
 
 		 389 aa  172  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3420  CheW domain-containing protein  44.6 
 
 		 320 aa  144  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2797  putative CheW protein  36.54 
 
 		 265 aa  143  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.198495  normal  0.208066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1534  putative CheW protein  40.33 
 
 		 298 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.357648 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4333  CheW domain-containing protein  40.33 
 
 		 298 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1571  CheW protein  39.43 
 
 		 317 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.99203  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3902  CheW protein  43.97 
 
 		 296 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3659  CheW protein  43.26 
 
 		 291 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3429  CheW-like protein  40 
 
 		 300 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.730107 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45510  CheW domain-containing protein  42.55 
 
 		 296 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3863  hypothetical protein  42.55 
 
 		 296 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.715886  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1967  CheW domain-containing protein  39.9 
 
 		 260 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1987  CheW domain protein  41.13 
 
 		 295 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.998121  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1346  CheW protein  40.28 
 
 		 247 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.22411  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2156  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.73 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0991  CheW protein  35.21 
 
 		 290 aa  99.8  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0500652  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0471  putative CheW protein  34.93 
 
 		 316 aa  99  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.404706  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1183  CheW domain protein  33.56 
 
 		 243 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.14971 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0206  CheW domain protein  25.87 
 
 		 164 aa  43.1  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00161643  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1529  CheW protein  26.35 
 
 		 163 aa  42.7  0.009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>