41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1642 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1642  CheW protein  100 
 
 		 338 aa  681    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.991032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3042  CheW protein  58.09 
 
 		 377 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1390  CheW protein  52.63 
 
 		 329 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.180967 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2912  putative CheW protein  52.17 
 
 		 336 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.696236  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2902  putative CheW protein  52.63 
 
 		 336 aa  335  7e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.144526  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3044  putative CheW protein  52.63 
 
 		 336 aa  335  7e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.630998 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1461  CheW protein  52.79 
 
 		 331 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3203  CheW domain-containing protein  52.6 
 
 		 326 aa  331  1e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1306  CheW protein  52.31 
 
 		 335 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.975654 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1366  CheW protein  52.44 
 
 		 335 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898971 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1373  CheW protein  51.16 
 
 		 335 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.171778 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2273  CheW domain-containing protein  50.55 
 
 		 359 aa  323  4e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.607284  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1350  CheW-like protein  47.27 
 
 		 343 aa  319  5e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2552  putative CheW protein  50.58 
 
 		 330 aa  316  5e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1206  CheW protein  45.45 
 
 		 360 aa  296  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.750839  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1385  CheW protein  47.02 
 
 		 305 aa  276  5e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02864  CheW protein  40.82 
 
 		 271 aa  203  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1527  cheW-like domain-containing protein  57.86 
 
 		 238 aa  188  9e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.54686  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2284  cheW-like protein  47.9 
 
 		 363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1648  hypothetical protein  40.48 
 
 		 338 aa  176  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002838  hypothetical protein  43.84 
 
 		 359 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3024  CheW protein  50 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03138  hypothetical protein  52.48 
 
 		 389 aa  169  9e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4333  CheW domain-containing protein  38.89 
 
 		 298 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1534  putative CheW protein  38.89 
 
 		 298 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.357648 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1967  CheW domain-containing protein  36.04 
 
 		 260 aa  135  9e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3420  CheW domain-containing protein  43.88 
 
 		 320 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3902  CheW protein  44.06 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3659  CheW protein  43.36 
 
 		 291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1571  CheW protein  40.24 
 
 		 317 aa  133  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.99203  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3863  hypothetical protein  42.66 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.715886  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45510  CheW domain-containing protein  42.66 
 
 		 296 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2797  putative CheW protein  41.67 
 
 		 265 aa  129  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.198495  normal  0.208066 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3429  CheW-like protein  37.35 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.730107 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1987  CheW domain protein  41.96 
 
 		 295 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.998121  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1346  CheW protein  42.96 
 
 		 247 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.22411  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2156  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.86 
 
 		 385 aa  119  9e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0471  putative CheW protein  34.69 
 
 		 316 aa  99  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.404706  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0991  CheW protein  35.21 
 
 		 290 aa  97.1  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0500652  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1183  CheW domain protein  34.01 
 
 		 243 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.14971 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0723  hypothetical protein  24.55 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>