40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1648 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1648  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  684    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002838  hypothetical protein  54.19 
 
 		 359 aa  350  3e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03138  hypothetical protein  62.84 
 
 		 389 aa  333  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2284  cheW-like protein  42.51 
 
 		 363 aa  278  8e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1390  CheW protein  37.24 
 
 		 329 aa  188  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.180967 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2273  CheW domain-containing protein  34.08 
 
 		 359 aa  187  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.607284  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02864  CheW protein  57.45 
 
 		 271 aa  179  5.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1350  CheW-like protein  45.19 
 
 		 343 aa  178  9e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3203  CheW domain-containing protein  42.79 
 
 		 326 aa  178  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2912  putative CheW protein  49.4 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.696236  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1373  CheW protein  47.31 
 
 		 335 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.171778 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1306  CheW protein  46.2 
 
 		 335 aa  176  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.975654 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1366  CheW protein  42.92 
 
 		 335 aa  176  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898971 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3044  putative CheW protein  52.03 
 
 		 336 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.630998 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2902  putative CheW protein  52.03 
 
 		 336 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.144526  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1461  CheW protein  52.03 
 
 		 331 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1642  CheW protein  40.48 
 
 		 338 aa  176  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.991032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2552  putative CheW protein  43.58 
 
 		 330 aa  176  6e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1206  CheW protein  38.1 
 
 		 360 aa  175  8e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.750839  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3042  CheW protein  54.23 
 
 		 377 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1527  cheW-like domain-containing protein  50.34 
 
 		 238 aa  163  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.54686  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1385  CheW protein  34.13 
 
 		 305 aa  162  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3024  CheW protein  46.62 
 
 		 287 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3429  CheW-like protein  36.65 
 
 		 300 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.730107 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1534  putative CheW protein  43.57 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.357648 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3902  CheW protein  43.57 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4333  CheW domain-containing protein  43.57 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2797  putative CheW protein  36.87 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.198495  normal  0.208066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1571  CheW protein  42.14 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.99203  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3659  CheW protein  35.83 
 
 		 291 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1967  CheW domain-containing protein  36.18 
 
 		 260 aa  123  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1987  CheW domain protein  37.71 
 
 		 295 aa  123  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.998121  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3863  hypothetical protein  42.86 
 
 		 296 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.715886  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45510  CheW domain-containing protein  42.86 
 
 		 296 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2156  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.84 
 
 		 385 aa  114  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3420  CheW domain-containing protein  36.96 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1346  CheW protein  37.91 
 
 		 247 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.22411  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0471  putative CheW protein  36.17 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.404706  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0991  CheW protein  34.86 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0500652  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1183  CheW domain protein  30.34 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.14971 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>