44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3024 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3024  CheW protein  100 
 
 		 287 aa  589  1e-167  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02864  CheW protein  43.66 
 
 		 271 aa  208  7e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1527  cheW-like domain-containing protein  57.55 
 
 		 238 aa  185  6e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.54686  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2273  CheW domain-containing protein  49.31 
 
 		 359 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.607284  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1642  CheW protein  50 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.991032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1390  CheW protein  35.32 
 
 		 329 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.180967 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1385  CheW protein  48.63 
 
 		 305 aa  170  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1306  CheW protein  41.4 
 
 		 335 aa  170  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.975654 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1206  CheW protein  48.28 
 
 		 360 aa  169  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.750839  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2902  putative CheW protein  46 
 
 		 336 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.144526  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3044  putative CheW protein  46 
 
 		 336 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.630998 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2912  putative CheW protein  46 
 
 		 336 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.696236  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1461  CheW protein  46 
 
 		 331 aa  169  5e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1350  CheW-like protein  44.91 
 
 		 343 aa  169  6e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1373  CheW protein  46 
 
 		 335 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.171778 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3042  CheW protein  47.92 
 
 		 377 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1366  CheW protein  37.71 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898971 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3203  CheW domain-containing protein  46 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2552  putative CheW protein  36.22 
 
 		 330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2284  cheW-like protein  46.58 
 
 		 363 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1648  hypothetical protein  46.62 
 
 		 338 aa  152  8.999999999999999e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002838  hypothetical protein  46.94 
 
 		 359 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03138  hypothetical protein  46.21 
 
 		 389 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2156  flagellar hook-basal body complex protein FliE  46.43 
 
 		 385 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3420  CheW domain-containing protein  44.22 
 
 		 320 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1967  CheW domain-containing protein  38.79 
 
 		 260 aa  132  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1571  CheW protein  39.39 
 
 		 317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.99203  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2797  putative CheW protein  42.86 
 
 		 265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.198495  normal  0.208066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3863  hypothetical protein  30.37 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.715886  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1534  putative CheW protein  41.26 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.357648 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4333  CheW domain-containing protein  41.26 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45510  CheW domain-containing protein  42.66 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3902  CheW protein  41.26 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3429  CheW-like protein  39.6 
 
 		 300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.730107 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1987  CheW domain protein  39.6 
 
 		 295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.998121  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3659  CheW protein  39.86 
 
 		 291 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1346  CheW protein  36.97 
 
 		 247 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.22411  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0471  putative CheW protein  36.17 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.404706  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0991  CheW protein  36.17 
 
 		 290 aa  97.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0500652  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1183  CheW domain protein  27.97 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.14971 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0723  hypothetical protein  25.74 
 
 		 289 aa  46.6  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  25.75 
 
 		 170 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4945  CheW protein  23.81 
 
 		 170 aa  43.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  25.75 
 
 		 170 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>