40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2156 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2156  flagellar hook-basal body complex protein FliE  100 
 
 		 385 aa  775    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2797  putative CheW protein  55.78 
 
 		 265 aa  189  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.198495  normal  0.208066 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45510  CheW domain-containing protein  56.55 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3863  hypothetical protein  56.55 
 
 		 296 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.715886  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3902  CheW protein  53.42 
 
 		 296 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4333  CheW domain-containing protein  53.42 
 
 		 298 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1534  putative CheW protein  53.42 
 
 		 298 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.357648 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3429  CheW-like protein  52.74 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.730107 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1987  CheW domain protein  53.42 
 
 		 295 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.998121  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3659  CheW protein  53.42 
 
 		 291 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1571  CheW protein  53.42 
 
 		 317 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.99203  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3420  CheW domain-containing protein  47.71 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1967  CheW domain-containing protein  45.14 
 
 		 260 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3024  CheW protein  46.43 
 
 		 287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02864  CheW protein  46.04 
 
 		 271 aa  138  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1346  CheW protein  39.46 
 
 		 247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.22411  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3042  CheW protein  30.71 
 
 		 377 aa  126  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2273  CheW domain-containing protein  33.73 
 
 		 359 aa  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.607284  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1385  CheW protein  38.85 
 
 		 305 aa  124  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1527  cheW-like domain-containing protein  40.85 
 
 		 238 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.54686  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2902  putative CheW protein  37.86 
 
 		 336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.144526  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1461  CheW protein  37.86 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2912  putative CheW protein  37.86 
 
 		 336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.696236  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1350  CheW-like protein  32.41 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3044  putative CheW protein  37.86 
 
 		 336 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.630998 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1306  CheW protein  38.13 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.975654 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1373  CheW protein  38.13 
 
 		 335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.171778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1366  CheW protein  38.13 
 
 		 335 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898971 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1642  CheW protein  37.86 
 
 		 338 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.991032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2284  cheW-like protein  41.01 
 
 		 363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2552  putative CheW protein  37.41 
 
 		 330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3203  CheW domain-containing protein  37.41 
 
 		 326 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1390  CheW protein  34.3 
 
 		 329 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.180967 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1206  CheW protein  39.57 
 
 		 360 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.750839  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1648  hypothetical protein  33.84 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03138  hypothetical protein  39.42 
 
 		 389 aa  110  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002838  hypothetical protein  34.3 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0471  putative CheW protein  36.99 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.404706  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0991  CheW protein  34.23 
 
 		 290 aa  95.5  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0500652  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1183  CheW domain protein  33.33 
 
 		 243 aa  92.8  9e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.14971 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>