40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1183 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1183  CheW domain protein  100 
 
 		 243 aa  481  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.14971 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1346  CheW protein  38.15 
 
 		 247 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.22411  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1373  CheW protein  31.91 
 
 		 335 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.171778 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3203  CheW domain-containing protein  31.89 
 
 		 326 aa  96.7  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1306  CheW protein  30.4 
 
 		 335 aa  95.1  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.975654 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1366  CheW protein  30.85 
 
 		 335 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898971 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2156  flagellar hook-basal body complex protein FliE  32.89 
 
 		 385 aa  94.7  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2797  putative CheW protein  32.86 
 
 		 265 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.198495  normal  0.208066 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45510  CheW domain-containing protein  31.68 
 
 		 296 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2552  putative CheW protein  29.83 
 
 		 330 aa  92  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1385  CheW protein  34.48 
 
 		 305 aa  90.5  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2284  cheW-like protein  32.19 
 
 		 363 aa  90.9  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3863  hypothetical protein  32.17 
 
 		 296 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.715886  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0471  putative CheW protein  37.14 
 
 		 316 aa  89.7  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.404706  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3044  putative CheW protein  31.97 
 
 		 336 aa  89  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.630998 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2273  CheW domain-containing protein  33.56 
 
 		 359 aa  88.6  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.607284  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2902  putative CheW protein  31.97 
 
 		 336 aa  88.6  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.144526  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2912  putative CheW protein  31.97 
 
 		 336 aa  89  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.696236  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1461  CheW protein  31.97 
 
 		 331 aa  88.6  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1571  CheW protein  32.39 
 
 		 317 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.99203  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1642  CheW protein  32.12 
 
 		 338 aa  87.8  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.991032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1350  CheW-like protein  31.02 
 
 		 343 aa  86.7  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1206  CheW protein  31.76 
 
 		 360 aa  85.5  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.750839  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1390  CheW protein  30.06 
 
 		 329 aa  85.5  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.180967 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4333  CheW domain-containing protein  31.21 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1534  putative CheW protein  31.21 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.357648 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3042  CheW protein  30.3 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3902  CheW protein  30.77 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002838  hypothetical protein  30.72 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02864  CheW protein  30.56 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1648  hypothetical protein  28.7 
 
 		 338 aa  82  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1987  CheW domain protein  30.07 
 
 		 295 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.998121  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3659  CheW protein  30.07 
 
 		 291 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3429  CheW-like protein  29.27 
 
 		 300 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.730107 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3420  CheW domain-containing protein  26.97 
 
 		 320 aa  79.3  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03138  hypothetical protein  30.07 
 
 		 389 aa  78.6  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3024  CheW protein  27.97 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1527  cheW-like domain-containing protein  24.58 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.54686  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0991  CheW protein  32.62 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0500652  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1967  CheW domain-containing protein  28.26 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>