40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3429 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3429  CheW-like protein  100 
 
 		 300 aa  599  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.730107 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1987  CheW domain protein  87.67 
 
 		 295 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.998121  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3659  CheW protein  69.86 
 
 		 291 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4333  CheW domain-containing protein  64.26 
 
 		 298 aa  355  5e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1534  putative CheW protein  64.26 
 
 		 298 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.357648 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1571  CheW protein  61.66 
 
 		 317 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.99203  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3902  CheW protein  63.87 
 
 		 296 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2797  putative CheW protein  66.44 
 
 		 265 aa  347  1e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.198495  normal  0.208066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3863  hypothetical protein  57.45 
 
 		 296 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.715886  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45510  CheW domain-containing protein  58.31 
 
 		 296 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2156  flagellar hook-basal body complex protein FliE  52.74 
 
 		 385 aa  182  9.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3420  CheW domain-containing protein  50.35 
 
 		 320 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1967  CheW domain-containing protein  38.63 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02864  CheW protein  34.32 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2273  CheW domain-containing protein  40 
 
 		 359 aa  140  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.607284  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3044  putative CheW protein  35.32 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.630998 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1461  CheW protein  35.68 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2902  putative CheW protein  35.32 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.144526  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2912  putative CheW protein  38.85 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.696236  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1390  CheW protein  37.7 
 
 		 329 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.180967 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1385  CheW protein  41.96 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002838  hypothetical protein  35.98 
 
 		 359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1366  CheW protein  34.42 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898971 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1306  CheW protein  37.29 
 
 		 335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.975654 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1648  hypothetical protein  33.46 
 
 		 338 aa  132  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2552  putative CheW protein  37.58 
 
 		 330 aa  132  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03138  hypothetical protein  44.22 
 
 		 389 aa  132  6e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1373  CheW protein  37.82 
 
 		 335 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.171778 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3203  CheW domain-containing protein  37.18 
 
 		 326 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1642  CheW protein  37.35 
 
 		 338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.991032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1350  CheW-like protein  34.76 
 
 		 343 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3024  CheW protein  39.6 
 
 		 287 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3042  CheW protein  37.2 
 
 		 377 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1346  CheW protein  39.52 
 
 		 247 aa  126  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.22411  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1527  cheW-like domain-containing protein  37.28 
 
 		 238 aa  125  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.54686  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2284  cheW-like protein  35.98 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1206  CheW protein  35.26 
 
 		 360 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.750839  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0991  CheW protein  42 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0500652  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0471  putative CheW protein  39.47 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.404706  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1183  CheW domain protein  29.37 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.14971 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>