59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3420 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3420  CheW domain-containing protein  100 
 
 		 320 aa  632  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45510  CheW domain-containing protein  38.44 
 
 		 296 aa  179  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3863  hypothetical protein  53.9 
 
 		 296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.715886  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2797  putative CheW protein  37.07 
 
 		 265 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.198495  normal  0.208066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1534  putative CheW protein  51.06 
 
 		 298 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.357648 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4333  CheW domain-containing protein  51.06 
 
 		 298 aa  172  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3902  CheW protein  51.06 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3429  CheW-like protein  50.35 
 
 		 300 aa  165  8e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.730107 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1987  CheW domain protein  51.06 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.998121  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1967  CheW domain-containing protein  51.77 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2156  flagellar hook-basal body complex protein FliE  47.71 
 
 		 385 aa  157  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2273  CheW domain-containing protein  44.6 
 
 		 359 aa  147  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.607284  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1306  CheW protein  45.32 
 
 		 335 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.975654 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1366  CheW protein  45.32 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898971 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1373  CheW protein  45.32 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.171778 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1527  cheW-like domain-containing protein  38.74 
 
 		 238 aa  143  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.54686  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02864  CheW protein  35.34 
 
 		 271 aa  143  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3203  CheW domain-containing protein  44.6 
 
 		 326 aa  143  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3044  putative CheW protein  44.6 
 
 		 336 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.630998 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2902  putative CheW protein  44.6 
 
 		 336 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.144526  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1461  CheW protein  44.6 
 
 		 331 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2912  putative CheW protein  44.6 
 
 		 336 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.696236  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2552  putative CheW protein  44.6 
 
 		 330 aa  142  8e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3042  CheW protein  43.88 
 
 		 377 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1385  CheW protein  43.48 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1350  CheW-like protein  44.6 
 
 		 343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1642  CheW protein  35.27 
 
 		 338 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.991032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1206  CheW protein  42.45 
 
 		 360 aa  136  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.750839  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1390  CheW protein  41.01 
 
 		 329 aa  136  4e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.180967 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3024  CheW protein  44.22 
 
 		 287 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1346  CheW protein  42.77 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.22411  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2284  cheW-like protein  39.13 
 
 		 363 aa  127  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03138  hypothetical protein  37.5 
 
 		 389 aa  123  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002838  hypothetical protein  34.39 
 
 		 359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1648  hypothetical protein  34.12 
 
 		 338 aa  113  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0991  CheW protein  37.84 
 
 		 290 aa  109  7.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0500652  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0471  putative CheW protein  36 
 
 		 316 aa  102  8e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.404706  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1183  CheW domain protein  26.97 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.14971 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  68.63 
 
 		 268 aa  53.5  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  50 
 
 		 444 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3480  regulator of polyketide synthase expression-like  43.24 
 
 		 539 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1631  sporulation domain-containing protein  35.04 
 
 		 525 aa  50.8  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  50 
 
 		 489 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  47.92 
 
 		 484 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  51.06 
 
 		 926 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  45.83 
 
 		 630 aa  47.8  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0436  hypothetical protein  56.25 
 
 		 613 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1434  hypothetical protein  35.56 
 
 		 772 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.709183  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0459  hypothetical protein  56.25 
 
 		 611 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0872017  normal  0.526818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0449  hypothetical protein  56.25 
 
 		 611 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00263959  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4621  hypothetical protein  38.46 
 
 		 481 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.957856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2735  hypothetical protein  33.33 
 
 		 967 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00121534  normal  0.0189028 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1573  hypothetical protein  44.23 
 
 		 1197 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.275879  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3849  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  38.81 
 
 		 468 aa  43.9  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  43.75 
 
 		 1261 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  30.36 
 
 		 1281 aa  43.5  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2374  glycosy hydrolase family protein  42.65 
 
 		 535 aa  43.5  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03550  hypothetical protein  43.1 
 
 		 1602 aa  43.1  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.122713  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  40.82 
 
 		 991 aa  42.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>