58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0991 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0991  CheW protein  100 
 
 
290 aa  565  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0500652  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0471  putative CheW protein  59.62 
 
 
316 aa  179  4e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.404706  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1346  CheW protein  37.01 
 
 
247 aa  143  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.22411  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4333  CheW domain-containing protein  40.88 
 
 
298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1534  putative CheW protein  40.88 
 
 
298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.357648 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1967  CheW domain-containing protein  40.96 
 
 
260 aa  127  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1571  CheW protein  43.42 
 
 
317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.99203  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3902  CheW protein  42.67 
 
 
296 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2797  putative CheW protein  40.31 
 
 
265 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.198495  normal  0.208066 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3429  CheW-like protein  42 
 
 
300 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.730107 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1987  CheW domain protein  41.61 
 
 
295 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.998121  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3659  CheW protein  41.61 
 
 
291 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3863  hypothetical protein  43.33 
 
 
296 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.715886  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45510  CheW domain-containing protein  43.33 
 
 
296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3420  CheW domain-containing protein  37.84 
 
 
320 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3042  CheW protein  36.17 
 
 
377 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1390  CheW protein  35.92 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.180967 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2912  putative CheW protein  30.25 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.696236  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1385  CheW protein  34.04 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02864  CheW protein  30.6 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1461  CheW protein  29.85 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1527  cheW-like domain-containing protein  29.58 
 
 
238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.54686  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3203  CheW domain-containing protein  30.59 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1642  CheW protein  30.21 
 
 
338 aa  113  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.991032  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3044  putative CheW protein  37.06 
 
 
336 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.630998 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2902  putative CheW protein  37.06 
 
 
336 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.144526  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1306  CheW protein  37.06 
 
 
335 aa  113  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.975654 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1373  CheW protein  37.06 
 
 
335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.171778 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2273  CheW domain-containing protein  35.21 
 
 
359 aa  112  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.607284  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1366  CheW protein  37.06 
 
 
335 aa  113  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898971 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2552  putative CheW protein  36.36 
 
 
330 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1350  CheW-like protein  27.72 
 
 
343 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3024  CheW protein  36.17 
 
 
287 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2156  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.23 
 
 
385 aa  106  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1206  CheW protein  30.28 
 
 
360 aa  102  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.750839  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03138  hypothetical protein  37.66 
 
 
389 aa  102  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002838  hypothetical protein  37.75 
 
 
359 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2284  cheW-like protein  33.33 
 
 
363 aa  97.8  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1648  hypothetical protein  34.86 
 
 
338 aa  96.7  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1183  CheW domain protein  32.64 
 
 
243 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.14971 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  30.97 
 
 
194 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0516  CheW protein  37.5 
 
 
171 aa  50.1  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1692  CheW protein  30.97 
 
 
191 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484464  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1763  CheW protein  30.97 
 
 
191 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  27.33 
 
 
165 aa  49.3  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  27.43 
 
 
173 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0521  CheW-like protein  37.37 
 
 
156 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.77009 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2157  putative CheW protein  31.11 
 
 
179 aa  46.6  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2213  putative CheW protein  28.12 
 
 
311 aa  45.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.542266 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0525  CheW protein  34.26 
 
 
157 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936934 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4612  CheW protein  30.48 
 
 
531 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  24.03 
 
 
161 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0961  CheW protein  35.19 
 
 
268 aa  43.5  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  24.58 
 
 
169 aa  42.7  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  35.64 
 
 
179 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0891  response regulator receiver modulated CheW protein  36.07 
 
 
312 aa  42.7  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.875715  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  27.68 
 
 
164 aa  42.4  0.008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1399  cheW domain-containing protein  37.31 
 
 
180 aa  42.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>