41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1206 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1206  CheW protein  100 
 
 		 360 aa  739    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.750839  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1350  CheW-like protein  58.11 
 
 		 343 aa  385  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1306  CheW protein  52.8 
 
 		 335 aa  344  1e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.975654 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1373  CheW protein  51.37 
 
 		 335 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.171778 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3203  CheW domain-containing protein  51.76 
 
 		 326 aa  341  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1366  CheW protein  51.79 
 
 		 335 aa  338  7e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898971 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2552  putative CheW protein  50.82 
 
 		 330 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2912  putative CheW protein  49.73 
 
 		 336 aa  334  2e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.696236  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2902  putative CheW protein  49.47 
 
 		 336 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.144526  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3044  putative CheW protein  49.73 
 
 		 336 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.630998 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1461  CheW protein  48.93 
 
 		 331 aa  325  5e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3042  CheW protein  45.02 
 
 		 377 aa  316  4e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0303282 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2273  CheW domain-containing protein  46.15 
 
 		 359 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.607284  normal  0.126231 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1390  CheW protein  47.62 
 
 		 329 aa  306  3e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.180967 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1642  CheW protein  45.45 
 
 		 338 aa  296  3e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.991032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1385  CheW protein  42.66 
 
 		 305 aa  264  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02864  CheW protein  43.75 
 
 		 271 aa  206  7e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2284  cheW-like protein  39.62 
 
 		 363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1527  cheW-like domain-containing protein  56.43 
 
 		 238 aa  184  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.54686  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1648  hypothetical protein  38.1 
 
 		 338 aa  175  9e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002838  hypothetical protein  36.9 
 
 		 359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03138  hypothetical protein  52.08 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3024  CheW protein  48.28 
 
 		 287 aa  169  6e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3420  CheW domain-containing protein  42.45 
 
 		 320 aa  135  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.859131  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4333  CheW domain-containing protein  37.82 
 
 		 298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1534  putative CheW protein  37.82 
 
 		 298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.357648 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3902  CheW protein  39.86 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3659  CheW protein  39.16 
 
 		 291 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1571  CheW protein  37.18 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.99203  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2797  putative CheW protein  35.54 
 
 		 265 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.198495  normal  0.208066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3863  hypothetical protein  38.46 
 
 		 296 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.715886  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45510  CheW domain-containing protein  38.46 
 
 		 296 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1346  CheW protein  41.03 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.22411  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1987  CheW domain protein  37.06 
 
 		 295 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.998121  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1967  CheW domain-containing protein  40.71 
 
 		 260 aa  123  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3429  CheW-like protein  35.26 
 
 		 300 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.730107 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2156  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.57 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0471  putative CheW protein  34.25 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.404706  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0991  CheW protein  30.28 
 
 		 290 aa  90.5  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0500652  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1183  CheW domain protein  31.76 
 
 		 243 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.14971 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0723  hypothetical protein  24.14 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>