81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0683 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0683  amino acid transporter protein  100 
 
 
529 aa  1033    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0128  amino acid permease-associated region  24.76 
 
 
443 aa  93.2  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000357804  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0924  amino acid permease-associated region  23.53 
 
 
449 aa  87.8  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.200497  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  25.59 
 
 
438 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  25.59 
 
 
438 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  25.59 
 
 
438 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  25.59 
 
 
438 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  25.59 
 
 
438 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  25.59 
 
 
438 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  25.59 
 
 
437 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  24.8 
 
 
437 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  25.2 
 
 
437 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1589  amino acid permease, putative  25.56 
 
 
450 aa  81.3  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000140221  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  24.41 
 
 
435 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2592  amino acid permease-associated region  25.16 
 
 
452 aa  77  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000351303  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  24.71 
 
 
443 aa  75.5  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  27.67 
 
 
453 aa  73.2  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  26.22 
 
 
499 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl664  putrescine/ornithine APC transporter  25.28 
 
 
577 aa  61.6  0.00000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2719  amino acid permease-associated region  27.17 
 
 
427 aa  61.2  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0307129  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3314  amino acid permease-associated region  25.55 
 
 
442 aa  61.2  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00103412  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  21.2 
 
 
443 aa  60.5  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl016  putrescine/ornithine APC transporter  25.62 
 
 
537 aa  60.5  0.00000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  26.18 
 
 
469 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0567  amino acid transporter  28.31 
 
 
452 aa  59.3  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0228349 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf753  amino acid permease  21.49 
 
 
561 aa  58.9  0.0000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0811  hypothetical protein  24.8 
 
 
515 aa  58.2  0.0000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  31.97 
 
 
387 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  21.5 
 
 
485 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  23.72 
 
 
426 aa  51.2  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  22.85 
 
 
440 aa  50.8  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl605  putative amino acid/amine (lysine) APC transporter  23.17 
 
 
462 aa  50.4  0.00007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  22.76 
 
 
461 aa  50.4  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1143  amino acid permease-associated region  27.61 
 
 
464 aa  49.7  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03986  arginine:agmatin  24.6 
 
 
445 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3912  arginine:agmatin antiporter  24.6 
 
 
445 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27107  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4580  arginine:agmatin antiporter  24.6 
 
 
445 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4612  arginine:agmatin antiporter  24.6 
 
 
445 aa  48.5  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5628  arginine:agmatin antiporter  24.6 
 
 
445 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  24.01 
 
 
445 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03947  hypothetical protein  24.6 
 
 
445 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4669  arginine:agmatin antiporter  24.6 
 
 
445 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4355  arginine:agmatin antiporter  24.6 
 
 
445 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.705479  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3877  amino acid permease-associated region  24.6 
 
 
445 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1006  lysine/cadaverine antiporter  23.38 
 
 
438 aa  48.1  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000705878  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1497  amino acid permease-associated region  23.4 
 
 
440 aa  48.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.649602  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  21.11 
 
 
555 aa  48.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3914  amino acid permease-associated region  21.3 
 
 
495 aa  48.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1526  amino acid permease-associated region  23.4 
 
 
440 aa  48.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0740999  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  23.98 
 
 
503 aa  47.8  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4549  arginine:agmatin antiporter  21.39 
 
 
445 aa  47.4  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226613  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1574  putrescine transporter  26.59 
 
 
436 aa  47  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  20.85 
 
 
532 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0409  amino acid permease-associated region  21.07 
 
 
532 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352811  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3592  amino acid transporter  21.07 
 
 
532 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1788  amino acid transporter  23.72 
 
 
466 aa  47  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000134575  hitchhiker  3.757e-23 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  27.87 
 
 
489 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4556  arginine:agmatin antiporter  26.45 
 
 
445 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  22.43 
 
 
745 aa  45.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  26.45 
 
 
445 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4640  arginine:agmatin antiporter  26.45 
 
 
445 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4640  arginine:agmatin antiporter  26.45 
 
 
445 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  23.67 
 
 
462 aa  45.8  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0441  amino acid permease-associated region  22.62 
 
 
740 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.238325  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2040  amino acid permease family protein  28.24 
 
 
479 aa  45.4  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0153737  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  21.69 
 
 
576 aa  44.3  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  21.13 
 
 
452 aa  44.3  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  21 
 
 
530 aa  44.3  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  21.69 
 
 
544 aa  44.7  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  36.21 
 
 
463 aa  44.7  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4682  putative fructoselysine transporter  23.67 
 
 
445 aa  43.9  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0342  putative fructoselysine transporter  23.67 
 
 
445 aa  43.9  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.473347 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03221  predicted fructoselysine transporter  23.67 
 
 
445 aa  43.9  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2801  amino acid permease  30.53 
 
 
476 aa  43.9  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764757  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0342  amino acid permease-associated region  23.67 
 
 
445 aa  43.9  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2694  amino acid permease-associated region  22.52 
 
 
450 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11519  normal  0.0425419 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03173  hypothetical protein  23.67 
 
 
445 aa  43.9  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2649  amino acid permease-associated region  22.52 
 
 
450 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0076  amino acid permease-associated region  22.43 
 
 
464 aa  43.5  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  23.67 
 
 
462 aa  43.5  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  23.67 
 
 
462 aa  43.5  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>