46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf753 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf753  amino acid permease  100 
 
 
561 aa  1118    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0811  hypothetical protein  25.93 
 
 
515 aa  77.8  0.0000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0924  amino acid permease-associated region  24.92 
 
 
449 aa  76.6  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.200497  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3609  amino acid permease-associated region  28.57 
 
 
435 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl664  putrescine/ornithine APC transporter  25.09 
 
 
577 aa  72  0.00000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  25.77 
 
 
453 aa  70.1  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  26.37 
 
 
437 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0128  amino acid permease-associated region  23.91 
 
 
443 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000357804  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  26.37 
 
 
437 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  26.37 
 
 
438 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  26.37 
 
 
438 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  26.37 
 
 
437 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  26.37 
 
 
438 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  26.37 
 
 
438 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  26.37 
 
 
438 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  26.37 
 
 
438 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl016  putrescine/ornithine APC transporter  25.98 
 
 
537 aa  64.3  0.000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2592  amino acid permease-associated region  24.85 
 
 
452 aa  62.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000351303  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3314  amino acid permease-associated region  29.52 
 
 
442 aa  60.8  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00103412  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1589  amino acid permease, putative  22.58 
 
 
450 aa  56.2  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000140221  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  22.6 
 
 
443 aa  55.8  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0867  amino acid transporter  28.71 
 
 
450 aa  53.9  0.000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00919336  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0445  amino acid permease  26.37 
 
 
426 aa  53.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000397922  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1885  amino acid permease  24.35 
 
 
664 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0469  amino acid permease  24.35 
 
 
541 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.343944  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  25.18 
 
 
476 aa  48.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16590  amino acid transporter  30 
 
 
461 aa  48.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0878  amino acid permease  24.48 
 
 
642 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.487607  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0567  amino acid permease  24.52 
 
 
666 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23606  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2193  amino acid permease  24.48 
 
 
642 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182525  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0084  threonine transporter  28.57 
 
 
387 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1002  amino acid permease-associated region  22.34 
 
 
499 aa  47.4  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3085  amino acid permease-associated region  29.33 
 
 
515 aa  47.4  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1421  amino acid permease  24.48 
 
 
519 aa  47.4  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  29.63 
 
 
463 aa  46.6  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2785  amino acid permease-associated region  32.05 
 
 
520 aa  47  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0177971 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1679  amino acid transporter  23.94 
 
 
440 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  22.34 
 
 
443 aa  45.4  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0241  amino acid permease  28.36 
 
 
543 aa  45.1  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4275  amino acid permease-associated region  24.44 
 
 
474 aa  44.3  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1714  amino acid permease-associated region  26.24 
 
 
473 aa  44.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2069  amino acid permease  23.05 
 
 
541 aa  44.3  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1961  amino acid permease-associated region  22.68 
 
 
469 aa  44.3  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0292842  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  26.67 
 
 
476 aa  43.9  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2320  amino acid transporter  25.87 
 
 
526 aa  43.9  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  27.17 
 
 
476 aa  43.5  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>