More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl605 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl605  putative amino acid/amine (lysine) APC transporter  100 
 
 
462 aa  919    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0342  putative fructoselysine transporter  27.55 
 
 
445 aa  134  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.473347 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3840  putative fructoselysine transporter  28.4 
 
 
462 aa  134  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3566  putative fructoselysine transporter  28.4 
 
 
462 aa  134  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03221  predicted fructoselysine transporter  27.55 
 
 
445 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0342  amino acid permease-associated region  27.55 
 
 
445 aa  133  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03173  hypothetical protein  27.55 
 
 
445 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4682  putative fructoselysine transporter  27.55 
 
 
445 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3748  putative fructoselysine transporter  27.48 
 
 
462 aa  130  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1855  amino acid transporter  24.87 
 
 
443 aa  99.8  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.599049  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  23.9 
 
 
544 aa  84  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  23.9 
 
 
576 aa  83.6  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0190  putative amino acid/amine transport protein  25.56 
 
 
452 aa  79.7  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1394  amino acid permease-associated region  21.89 
 
 
443 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2592  amino acid permease-associated region  24.36 
 
 
452 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000351303  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0924  amino acid permease-associated region  21.49 
 
 
449 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.200497  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0499  amino acid permease  24.1 
 
 
533 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3608  amino acid permease  24.1 
 
 
533 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1948  amino acid permease  24.1 
 
 
533 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3619  amino acid permease  24.1 
 
 
533 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3595  amino acid permease  24.1 
 
 
533 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243323  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0681  amino acid permease  24.1 
 
 
533 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0977  amino acid permease  24.1 
 
 
533 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2935  amino acid permease  24.04 
 
 
533 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  24.69 
 
 
538 aa  74.7  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  21.89 
 
 
453 aa  73.9  0.000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  22.06 
 
 
486 aa  72.4  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3351  amino acid transporter  22.22 
 
 
485 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  23.14 
 
 
503 aa  72  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  23.82 
 
 
506 aa  71.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  23.97 
 
 
530 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  24.4 
 
 
555 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5772  amino acid permease-associated region  23.97 
 
 
543 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  25.35 
 
 
500 aa  70.1  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  23.66 
 
 
543 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  23.77 
 
 
532 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  26.87 
 
 
466 aa  67.8  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  24.69 
 
 
517 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2893  amino acid permease-associated region  22.46 
 
 
532 aa  67  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0706357  normal  0.902102 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3592  amino acid transporter  24.45 
 
 
532 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1474  amino acid transporter  21.22 
 
 
445 aa  66.6  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221068  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3114  amino acid transporter  24.76 
 
 
446 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.988661  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  22.25 
 
 
494 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3314  amino acid permease-associated region  23.61 
 
 
442 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00103412  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0409  amino acid permease-associated region  24.65 
 
 
532 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352811  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1917  amino acid permease-associated region  22.22 
 
 
463 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.797134  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2863  amino acid permease  26.34 
 
 
528 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.817081  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  19.08 
 
 
436 aa  63.9  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0653  amino acid permease family protein  24.01 
 
 
472 aa  63.5  0.000000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  25.81 
 
 
528 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  21.02 
 
 
461 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0477  amino acid permease-associated region  23.81 
 
 
532 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.694981 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2601  amino acid permease-associated region  23.81 
 
 
532 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0305  amino acid permease-associated region  24.15 
 
 
468 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0504  amino acid permease-associated region  23.81 
 
 
532 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.907763  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3386  amino acid permease-associated region  25.63 
 
 
482 aa  62  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.944667  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0128  amino acid permease-associated region  22.84 
 
 
443 aa  62  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000357804  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0069  amino acid permease-associated region  21.13 
 
 
447 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.480186 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3285  amino acid transporter  20.41 
 
 
522 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0321  amino acid permease  23.18 
 
 
753 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  22.22 
 
 
495 aa  61.6  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3333  amino acid transporter  23.7 
 
 
480 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.326771  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  24.59 
 
 
439 aa  61.6  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3835  amino acid transporter  20 
 
 
439 aa  60.5  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  20 
 
 
422 aa  60.5  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  24.7 
 
 
773 aa  59.3  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2034  amino acid permease family protein  22.4 
 
 
559 aa  59.3  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000879129  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5157  amino acid permease family protein  23.26 
 
 
438 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4886  amino acid permease family protein  23.26 
 
 
438 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000145673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4728  amino acid permease  23.26 
 
 
438 aa  58.9  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000742695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4743  amino acid permease  23.26 
 
 
438 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000004453  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5163  amino acid permease family protein  22.87 
 
 
437 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5170  amino acid permease family protein  23.26 
 
 
437 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5261  amino acid permease family protein  23.26 
 
 
438 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00026519  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2701  amino acid transporter  19.69 
 
 
489 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0907  amino acid transporter  21.19 
 
 
486 aa  58.9  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.555245  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5129  amino acid permease family protein  23.26 
 
 
438 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1623  amino acid transporter  25.15 
 
 
427 aa  58.9  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000133426  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3770  amino acid permease-associated region  24.76 
 
 
444 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0601  amino acid permease-associated region  26.7 
 
 
466 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  22.88 
 
 
445 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03036  amino acid transporter  21.84 
 
 
516 aa  58.2  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4845  amino acid permease-associated region  23.55 
 
 
437 aa  58.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  24.54 
 
 
518 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5190  putative amino acid transporter  22.07 
 
 
458 aa  57.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.251586 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6715  amino acid permease-associated region  23.44 
 
 
486 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1676  amino acid permease-associated region  24.75 
 
 
469 aa  57.8  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.047453  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  21.76 
 
 
463 aa  57.4  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0439  putative proline-specific permease  29.02 
 
 
476 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.37513  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0458  putative proline-specific permease  29.02 
 
 
476 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0439  putative proline-specific permease  29.02 
 
 
476 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0500  putative proline-specific permease  29.02 
 
 
476 aa  57.4  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.968025  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00850  cationic amino acid transporter  21.61 
 
 
486 aa  57  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000549978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06077  cationic amino acid transporter  21.61 
 
 
486 aa  57  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00275694  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1651  amino acid permease-associated region  23.65 
 
 
501 aa  57  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0870  putative proline-specific permease  28.5 
 
 
456 aa  57  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1000  amino acid permease-associated region  23.76 
 
 
529 aa  56.6  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0445  putative proline-specific permease  28.5 
 
 
476 aa  56.6  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2503  amino acid permease-associated region  22.89 
 
 
530 aa  56.6  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.701941  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2477  amino acid permease-associated region  23.99 
 
 
545 aa  56.6  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000817564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>