50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1672 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1672  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  100 
 
 		 269 aa  545  1e-154  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.899552  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2702  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  55.77 
 
 		 266 aa  272  4.0000000000000004e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1390  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  50.58 
 
 		 242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1011  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  45.16 
 
 		 247 aa  192  4e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1095  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  45.16 
 
 		 247 aa  192  4e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1081  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  42.97 
 
 		 242 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0192235  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0610  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  41.6 
 
 		 249 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2824  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  44 
 
 		 264 aa  169  6e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2477  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  38.4 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1979  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  40.21 
 
 		 278 aa  156  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1629  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  41.67 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3445  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  38.62 
 
 		 270 aa  149  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.423175 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1254  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  41.67 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320437 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1026  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  38.13 
 
 		 272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000281722  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1635  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  40.8 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000227023  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3258  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  35.39 
 
 		 251 aa  125  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1754  hypothetical protein  39.08 
 
 		 233 aa  122  7e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2452  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  35.74 
 
 		 285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.673102  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0742  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  40.61 
 
 		 242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0975  hypothetical protein  39.91 
 
 		 220 aa  119  7e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0171126  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0217  Csm3 family CRISPR-associated RAMP protein  40 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1347  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  40.69 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0701  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  39.73 
 
 		 225 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.490218  hitchhiker  0.00485389 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12835  hypothetical protein  33.08 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2459  CRISPR-associated Cmr4 family protein  38.27 
 
 		 214 aa  101  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00633157  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2048  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  35.11 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1544  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  30.66 
 
 		 329 aa  98.2  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.352642  normal  0.26892 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1364  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  28.87 
 
 		 331 aa  89  7e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.152011  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1149  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  31.25 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.19173  hitchhiker  0.000019358 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2051  CRISPR-associated Csm3 family protein  30.68 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0365  CRISPR-associated Csm3 family protein  28.7 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395983 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0188  CRISPR-associated Csm3 family protein  27.43 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0740  hypothetical protein  26.64 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0101279  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2390  SSO1426 family CRISPR-associated RAMP protein  46.67 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.293028  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1859  hypothetical protein  29.06 
 
 		 594 aa  55.8  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1442  CRISPR-associated Csm3 family protein  43.1 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141545 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1801  CRISPR-associated Csm3 family protein  23.46 
 
 		 282 aa  52.4  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0744  hypothetical protein  27.32 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0162344  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0981  protein of unknown function DUF324  26.11 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5586  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  25.4 
 
 		 280 aa  49.3  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.199853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5587  protein of unknown function DUF324  28.64 
 
 		 315 aa  47.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0739  hypothetical protein  22.32 
 
 		 429 aa  47  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0915  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  28.09 
 
 		 354 aa  45.8  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.994799  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3292  hypothetical protein  25.76 
 
 		 622 aa  45.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.798448 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0984  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  23.4 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1288  CRISPR-associated Csm3 family protein  24.06 
 
 		 307 aa  43.5  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0685165  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_312  prolyl-tRNA synthetase  28.42 
 
 		 569 aa  43.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2054  hypothetical protein  23.44 
 
 		 181 aa  43.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0977  hypothetical protein  48.89 
 
 		 357 aa  42.4  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3812  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  34.38 
 
 		 449 aa  42.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.458595 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>