51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0740 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0740  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  530  1e-149  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0101279  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2051  CRISPR-associated Csm3 family protein  30.28 
 
 		 260 aa  96.7  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5586  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  29.56 
 
 		 280 aa  93.2  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.199853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1442  CRISPR-associated Csm3 family protein  29.84 
 
 		 267 aa  88.6  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141545 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1801  CRISPR-associated Csm3 family protein  32.1 
 
 		 282 aa  88.6  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0188  CRISPR-associated Csm3 family protein  27.88 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0984  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  35.14 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2390  SSO1426 family CRISPR-associated RAMP protein  31.03 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.293028  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0365  CRISPR-associated Csm3 family protein  25.55 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395983 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2050  CRISPR-associated Csm3 family protein  28.45 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0985  protein of unknown function DUF324  31.47 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1800  hypothetical protein  31.65 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1011  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  30.54 
 
 		 247 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1095  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  30.54 
 
 		 247 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1443  hypothetical protein  32.76 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0712178 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5587  protein of unknown function DUF324  29.48 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0739  hypothetical protein  29.44 
 
 		 429 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1439  hypothetical protein  34.17 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111191 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2385  hypothetical protein  27.69 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0610  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  29.39 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1804  hypothetical protein  28.43 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0744  hypothetical protein  25.12 
 
 		 219 aa  62  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0162344  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0981  protein of unknown function DUF324  26.42 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2477  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  29.33 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1672  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  26.64 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.899552  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2824  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  27.88 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1390  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  25.3 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1287  CRISPR-associated Csm3 family protein  31.09 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.609283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1860  hypothetical protein  25.65 
 
 		 821 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.441776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1288  CRISPR-associated Csm3 family protein  27.27 
 
 		 307 aa  54.7  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0685165  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1918  hypothetical protein  27.85 
 
 		 513 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1161  CRISPR-associated Csx7 family protein  26.9 
 
 		 282 aa  52.4  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.59336  hitchhiker  0.00757758 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1070  protein of unknown function DUF324  24.65 
 
 		 597 aa  52  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1859  hypothetical protein  24.66 
 
 		 594 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2452  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  25.27 
 
 		 285 aa  50.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.673102  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1007  hypothetical protein  29.59 
 
 		 558 aa  49.7  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1160  CRISPR-associated Csx7 family protein  30.67 
 
 		 254 aa  48.9  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.791227  normal  0.0434649 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1979  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  28.74 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3292  hypothetical protein  30.25 
 
 		 622 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.798448 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1164  hypothetical protein  31.29 
 
 		 211 aa  48.5  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00846992 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1754  hypothetical protein  27.07 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0701  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  30 
 
 		 225 aa  46.2  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.490218  hitchhiker  0.00485389 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1228  protein of unknown function DUF324  28.65 
 
 		 453 aa  45.4  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.726427  normal  0.459796 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3445  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  26.34 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.423175 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1635  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  32.35 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000227023  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2459  CRISPR-associated Cmr4 family protein  29.74 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00633157  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0975  hypothetical protein  26.47 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0171126  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2392  hypothetical protein  25.71 
 
 		 338 aa  44.3  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.556583  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20530  uncharacterized RAMP superfamily protein probably involved in DNA repair  28.57 
 
 		 415 aa  43.5  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1834  hypothetical protein  25.27 
 
 		 472 aa  43.5  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1677  CRISPR-associated RAMP protein  24.44 
 
 		 450 aa  42.7  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.71005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>