34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0985 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0985  protein of unknown function DUF324  100 
 
 
298 aa  599  1e-170  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1800  hypothetical protein  65.67 
 
 
299 aa  398  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2392  hypothetical protein  38.59 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.556583  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1443  hypothetical protein  38.41 
 
 
294 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0712178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0364  hypothetical protein  33.61 
 
 
354 aa  153  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00389442 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0187  hypothetical protein  35.01 
 
 
355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5587  protein of unknown function DUF324  35.13 
 
 
315 aa  128  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366064  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2050  CRISPR-associated Csm3 family protein  33.33 
 
 
279 aa  123  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0984  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  38.86 
 
 
274 aa  119  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1801  CRISPR-associated Csm3 family protein  40.71 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1288  CRISPR-associated Csm3 family protein  33.74 
 
 
307 aa  92.4  9e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0685165  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2051  CRISPR-associated Csm3 family protein  30.53 
 
 
260 aa  88.6  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1859  hypothetical protein  32.37 
 
 
594 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1070  protein of unknown function DUF324  32.65 
 
 
597 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478197  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0740  hypothetical protein  31.47 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0101279  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5586  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  35.89 
 
 
280 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.199853  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1161  CRISPR-associated Csx7 family protein  30.57 
 
 
282 aa  73.2  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.59336  hitchhiker  0.00757758 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1442  CRISPR-associated Csm3 family protein  31.1 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.141545 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3292  hypothetical protein  30.77 
 
 
622 aa  72.8  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.798448 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1287  CRISPR-associated Csm3 family protein  30.14 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.609283  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0188  CRISPR-associated Csm3 family protein  35.63 
 
 
288 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0365  CRISPR-associated Csm3 family protein  33.53 
 
 
289 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395983 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1804  hypothetical protein  30.73 
 
 
240 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0739  hypothetical protein  23.84 
 
 
429 aa  52.8  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0981  protein of unknown function DUF324  26.96 
 
 
237 aa  50.8  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0138  protein of unknown function DUF324  27.59 
 
 
474 aa  50.4  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20530  uncharacterized RAMP superfamily protein probably involved in DNA repair  32.14 
 
 
415 aa  50.4  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1160  CRISPR-associated Csx7 family protein  28.89 
 
 
254 aa  50.1  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.791227  normal  0.0434649 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2054  hypothetical protein  26.09 
 
 
181 aa  49.3  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2390  SSO1426 family CRISPR-associated RAMP protein  28.24 
 
 
299 aa  48.9  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.293028  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2526  hypothetical protein  24.66 
 
 
504 aa  47.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2049  hypothetical protein  25.33 
 
 
294 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1007  hypothetical protein  36 
 
 
558 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1445  hypothetical protein  25.69 
 
 
330 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0696402 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>