44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0981 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0981  protein of unknown function DUF324  100 
 
 
237 aa  474  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1804  hypothetical protein  50.42 
 
 
240 aa  219  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1439  hypothetical protein  36.32 
 
 
223 aa  108  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0111191 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0191  hypothetical protein  31.5 
 
 
214 aa  90.9  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.667263  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2385  hypothetical protein  28.64 
 
 
252 aa  78.6  0.00000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0368  hypothetical protein  30.95 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100802 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0984  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  31.67 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1288  CRISPR-associated Csm3 family protein  29.05 
 
 
307 aa  68.9  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0685165  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5586  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  30.39 
 
 
280 aa  67  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.199853  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1293  hypothetical protein  38.46 
 
 
288 aa  64.3  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1442  CRISPR-associated Csm3 family protein  28.83 
 
 
267 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.141545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0744  hypothetical protein  31.58 
 
 
219 aa  63.2  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0162344  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0188  CRISPR-associated Csm3 family protein  28.21 
 
 
288 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0740  hypothetical protein  26.42 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0101279  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2702  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  26.88 
 
 
266 aa  60.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0365  CRISPR-associated Csm3 family protein  27.35 
 
 
289 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395983 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2054  hypothetical protein  27.47 
 
 
181 aa  60.1  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2051  CRISPR-associated Csm3 family protein  27.43 
 
 
260 aa  58.9  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5584  protein of unknown function DUF324  29.61 
 
 
649 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0610  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  28.37 
 
 
249 aa  57.4  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1095  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  26.84 
 
 
247 aa  56.6  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1011  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  26.84 
 
 
247 aa  56.6  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1081  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  30.23 
 
 
242 aa  56.2  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0192235  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1801  CRISPR-associated Csm3 family protein  30.14 
 
 
282 aa  55.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1860  hypothetical protein  25.23 
 
 
821 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.441776  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1800  hypothetical protein  29.61 
 
 
299 aa  52.4  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2390  SSO1426 family CRISPR-associated RAMP protein  27.08 
 
 
299 aa  52  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.293028  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1071  protein of unknown function DUF324  27.54 
 
 
778 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1672  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  26.11 
 
 
269 aa  51.2  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.899552  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0985  protein of unknown function DUF324  26.96 
 
 
298 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5587  protein of unknown function DUF324  30.41 
 
 
315 aa  49.7  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366064  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1390  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  25.71 
 
 
242 aa  49.3  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2824  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  26.85 
 
 
264 aa  47.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3293  hypothetical protein  24.27 
 
 
776 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.642367  normal  0.855999 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1443  hypothetical protein  27.8 
 
 
294 aa  45.4  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0712178 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1161  CRISPR-associated Csx7 family protein  24.69 
 
 
282 aa  44.7  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.59336  hitchhiker  0.00757758 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1008  hypothetical protein  28.9 
 
 
808 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226186  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1070  protein of unknown function DUF324  26.7 
 
 
597 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478197  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0739  hypothetical protein  27.61 
 
 
429 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2452  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  23.53 
 
 
285 aa  44.3  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.673102  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1160  CRISPR-associated Csx7 family protein  24.26 
 
 
254 aa  43.1  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.791227  normal  0.0434649 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0158  hypothetical protein  21.46 
 
 
390 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.59719 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20530  uncharacterized RAMP superfamily protein probably involved in DNA repair  27.94 
 
 
415 aa  43.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2050  CRISPR-associated Csm3 family protein  22.87 
 
 
279 aa  42  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>