16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0191 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0191  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  419  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.667263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0368  hypothetical protein  72.9 
 
 		 217 aa  282  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100802 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2385  hypothetical protein  32.54 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0981  protein of unknown function DUF324  31.5 
 
 		 237 aa  90.9  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1804  hypothetical protein  29.79 
 
 		 240 aa  53.1  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1008  hypothetical protein  30.23 
 
 		 808 aa  52.4  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1071  protein of unknown function DUF324  28.57 
 
 		 778 aa  49.7  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1439  hypothetical protein  26.74 
 
 		 223 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111191 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2054  hypothetical protein  21.55 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2527  hypothetical protein  26.54 
 
 		 791 aa  47  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1081  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  26.52 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0192235  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3293  hypothetical protein  27.91 
 
 		 776 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.642367  normal  0.855999 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2459  CRISPR-associated Cmr4 family protein  30.19 
 
 		 214 aa  45.4  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00633157  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1288  CRISPR-associated Csm3 family protein  26.58 
 
 		 307 aa  44.7  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0685165  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1070  protein of unknown function DUF324  31.82 
 
 		 597 aa  43.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1916  hypothetical protein  24.5 
 
 		 228 aa  41.6  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>