52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2459 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2459  CRISPR-associated Cmr4 family protein  100 
 
 		 214 aa  436  1e-121  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00633157  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0975  hypothetical protein  50 
 
 		 220 aa  191  6e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0171126  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1754  hypothetical protein  48.33 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12835  hypothetical protein  41.59 
 
 		 236 aa  165  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1011  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  43.9 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1095  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  43.13 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2824  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  43.88 
 
 		 264 aa  152  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2477  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  37.27 
 
 		 255 aa  135  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0610  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  38.61 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1254  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  39.15 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320437 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3445  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  37.05 
 
 		 270 aa  132  5e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.423175 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1390  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  39.6 
 
 		 242 aa  127  9.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1081  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  39.81 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0192235  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2702  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  40.97 
 
 		 266 aa  125  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2048  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  34.44 
 
 		 285 aa  123  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1979  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  34.78 
 
 		 278 aa  122  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1629  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  39.2 
 
 		 215 aa  121  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1672  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  38.43 
 
 		 269 aa  119  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.899552  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1026  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  33.18 
 
 		 272 aa  115  6e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000281722  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1635  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  35.32 
 
 		 264 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000227023  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0701  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  37.33 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.490218  hitchhiker  0.00485389 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0217  Csm3 family CRISPR-associated RAMP protein  36.32 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0742  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  36.98 
 
 		 242 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2452  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  32.08 
 
 		 285 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.673102  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1347  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  37.21 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3258  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  35.59 
 
 		 251 aa  99.8  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1364  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  25 
 
 		 331 aa  78.2  0.00000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.152011  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1544  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  28.63 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.352642  normal  0.26892 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1149  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  26.94 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.19173  hitchhiker  0.000019358 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1949  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  45.45 
 
 		 298 aa  53.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0318  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  31.34 
 
 		 292 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1160  CRISPR-associated Csx7 family protein  26.13 
 
 		 254 aa  52.4  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.791227  normal  0.0434649 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0739  hypothetical protein  28.05 
 
 		 429 aa  52  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2051  CRISPR-associated Csm3 family protein  28.51 
 
 		 260 aa  52  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3378  hypothetical protein  36.67 
 
 		 262 aa  50.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0740  hypothetical protein  28.44 
 
 		 257 aa  48.5  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0101279  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0962  CRISPR-associated RAMP Cmr4 family protein  34.44 
 
 		 264 aa  47  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.60167  normal  0.960375 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0108  CRISPR-associated RAMP Cmr4 family protein family protein  32.29 
 
 		 273 aa  45.1  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0120254  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2295  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  33.77 
 
 		 297 aa  45.4  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0191  hypothetical protein  30.19 
 
 		 214 aa  45.1  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.667263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0915  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  44.68 
 
 		 354 aa  45.1  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.994799  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0368  hypothetical protein  31.82 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100802 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2690  CRISPR-associated RAMP Cmr4 family protein family protein  37.5 
 
 		 283 aa  43.5  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1356  hypothetical protein  31.52 
 
 		 321 aa  43.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.278075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0365  CRISPR-associated Csm3 family protein  37.5 
 
 		 289 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395983 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2351  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  36.76 
 
 		 269 aa  42.7  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0188  CRISPR-associated Csm3 family protein  37.5 
 
 		 288 aa  42.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1482  Cmr4 family CRISPR-associated RAMP protein  31.87 
 
 		 245 aa  42.4  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.541255  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0660  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  43.18 
 
 		 258 aa  42.4  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0697  CRISPR-associated RAMP Cmr4 family protein family protein  40.43 
 
 		 293 aa  42.4  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2390  SSO1426 family CRISPR-associated RAMP protein  36.84 
 
 		 299 aa  41.6  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.293028  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0984  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  22.52 
 
 		 274 aa  41.6  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>