46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0742 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0742  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  100 
 
 		 242 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1347  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  68.33 
 
 		 241 aa  325  4.0000000000000003e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0217  Csm3 family CRISPR-associated RAMP protein  48.21 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0701  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  47.58 
 
 		 225 aa  171  6.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.490218  hitchhiker  0.00485389 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1629  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  42.98 
 
 		 215 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1011  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  44.5 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1095  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  44.5 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3258  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  41.87 
 
 		 251 aa  159  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1390  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  44.19 
 
 		 242 aa  155  6e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2702  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  40.22 
 
 		 266 aa  152  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2048  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  36.76 
 
 		 285 aa  149  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2477  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  36.82 
 
 		 255 aa  149  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2824  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  39.91 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2452  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  36.22 
 
 		 285 aa  146  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.673102  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1979  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  41.03 
 
 		 278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1672  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  40.61 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.899552  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3445  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  41.48 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.423175 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1254  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  40.91 
 
 		 244 aa  139  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320437 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1081  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  43.06 
 
 		 242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0192235  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0975  hypothetical protein  41.86 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0171126  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0610  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  41.07 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1635  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  38.16 
 
 		 264 aa  128  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000227023  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12835  hypothetical protein  41.23 
 
 		 236 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1026  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  38.27 
 
 		 272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000281722  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1754  hypothetical protein  38.36 
 
 		 233 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2459  CRISPR-associated Cmr4 family protein  39.02 
 
 		 214 aa  115  5e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00633157  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1149  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  28.74 
 
 		 307 aa  68.9  0.00000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.19173  hitchhiker  0.000019358 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1544  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  29.52 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.352642  normal  0.26892 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1364  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  28.68 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.152011  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2051  CRISPR-associated Csm3 family protein  27.71 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0739  hypothetical protein  28.82 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0984  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  27.13 
 
 		 274 aa  50.1  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0365  CRISPR-associated Csm3 family protein  30.57 
 
 		 289 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395983 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0188  CRISPR-associated Csm3 family protein  40.3 
 
 		 288 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1820  CRISPR-associated RAMP Cmr4 family protein family protein  33.64 
 
 		 288 aa  45.8  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303143  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0740  hypothetical protein  29.82 
 
 		 257 aa  45.8  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0101279  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1801  CRISPR-associated Csm3 family protein  43.64 
 
 		 282 aa  45.4  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1442  CRISPR-associated Csm3 family protein  26.67 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141545 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2295  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  32 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2589  CRISPR-associated RAMP Cmr4 family protein family protein  34.88 
 
 		 330 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.598353  normal  0.467768 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0576  CRISPR-associated RAMP Cmr4 family protein family protein  29.23 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0697  CRISPR-associated RAMP Cmr4 family protein family protein  30.39 
 
 		 293 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1356  hypothetical protein  31.82 
 
 		 321 aa  43.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.278075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1949  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  46.51 
 
 		 298 aa  42  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1160  CRISPR-associated Csx7 family protein  45.45 
 
 		 254 aa  42  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.791227  normal  0.0434649 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2690  CRISPR-associated RAMP Cmr4 family protein family protein  36.07 
 
 		 283 aa  41.6  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>