37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1026 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1026  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  100 
 
 		 272 aa  548  1e-155  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000281722  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1390  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  41.73 
 
 		 242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0610  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  43.61 
 
 		 249 aa  169  5e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2824  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  39.74 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1081  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  41.38 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0192235  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2702  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  40.64 
 
 		 266 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1011  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  40.96 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1095  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  40.96 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1672  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  38.13 
 
 		 269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.899552  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3445  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  37.26 
 
 		 270 aa  139  7e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.423175 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2477  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  37.61 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1254  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  37.93 
 
 		 244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320437 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1629  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  36.55 
 
 		 215 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1979  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  35.77 
 
 		 278 aa  132  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1635  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  39.75 
 
 		 264 aa  125  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000227023  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1754  hypothetical protein  35.06 
 
 		 233 aa  122  8e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0975  hypothetical protein  35.84 
 
 		 220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0171126  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2452  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  32.66 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.673102  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3258  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  36.21 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2048  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  33.59 
 
 		 285 aa  109  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0701  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  34.51 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.490218  hitchhiker  0.00485389 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0742  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  37.27 
 
 		 242 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0217  Csm3 family CRISPR-associated RAMP protein  34.33 
 
 		 224 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2459  CRISPR-associated Cmr4 family protein  33.18 
 
 		 214 aa  97.8  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00633157  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12835  hypothetical protein  32.63 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1347  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  32.5 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1364  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  28.52 
 
 		 331 aa  88.6  9e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.152011  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1544  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  27.96 
 
 		 329 aa  88.6  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.352642  normal  0.26892 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1149  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  31.42 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.19173  hitchhiker  0.000019358 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0739  hypothetical protein  30.26 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1801  CRISPR-associated Csm3 family protein  24.8 
 
 		 282 aa  53.9  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0188  CRISPR-associated Csm3 family protein  27.04 
 
 		 288 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0365  CRISPR-associated Csm3 family protein  27.78 
 
 		 289 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395983 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1288  CRISPR-associated Csm3 family protein  23.77 
 
 		 307 aa  49.3  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0685165  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0984  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  25.91 
 
 		 274 aa  48.9  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2051  CRISPR-associated Csm3 family protein  27.63 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5586  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  22.34 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.199853  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>