58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0365 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0365  CRISPR-associated Csm3 family protein  100 
 
 		 289 aa  578  1e-164  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395983 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0188  CRISPR-associated Csm3 family protein  83.39 
 
 		 288 aa  484  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2390  SSO1426 family CRISPR-associated RAMP protein  41.23 
 
 		 299 aa  155  8e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.293028  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1442  CRISPR-associated Csm3 family protein  36.04 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141545 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1801  CRISPR-associated Csm3 family protein  34.89 
 
 		 282 aa  126  5e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0984  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  35.93 
 
 		 274 aa  125  8.000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5586  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  35.22 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.199853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2051  CRISPR-associated Csm3 family protein  30.53 
 
 		 260 aa  103  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1288  CRISPR-associated Csm3 family protein  31.4 
 
 		 307 aa  92.4  7e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0685165  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5587  protein of unknown function DUF324  30.77 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0740  hypothetical protein  25.55 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0101279  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1800  hypothetical protein  33.92 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2050  CRISPR-associated Csm3 family protein  23.51 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0985  protein of unknown function DUF324  33.53 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1160  CRISPR-associated Csx7 family protein  28.34 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.791227  normal  0.0434649 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1672  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  28.7 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.899552  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0364  hypothetical protein  29.76 
 
 		 354 aa  63.5  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389442 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1161  CRISPR-associated Csx7 family protein  27.37 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.59336  hitchhiker  0.00757758 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1287  CRISPR-associated Csm3 family protein  31.98 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.609283  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0610  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  26.61 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2392  hypothetical protein  27.27 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.556583  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0981  protein of unknown function DUF324  27.35 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1443  hypothetical protein  30.86 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0712178 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2526  hypothetical protein  26.36 
 
 		 504 aa  58.9  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0739  hypothetical protein  24.11 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1804  hypothetical protein  28.05 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1254  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  27.06 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320437 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2385  hypothetical protein  25.37 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1070  protein of unknown function DUF324  30.32 
 
 		 597 aa  55.8  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1918  hypothetical protein  24.89 
 
 		 513 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0187  hypothetical protein  30.48 
 
 		 355 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1007  hypothetical protein  27.32 
 
 		 558 aa  52.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1095  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  24.78 
 
 		 247 aa  52  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1376  hypothetical protein  28.46 
 
 		 576 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1011  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  24.35 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3292  hypothetical protein  29.07 
 
 		 622 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.798448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1979  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  44.44 
 
 		 278 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1390  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  27.24 
 
 		 242 aa  49.3  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1026  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  27.78 
 
 		 272 aa  49.3  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000281722  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0742  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  44.26 
 
 		 242 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2824  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  38.46 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1629  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  39.29 
 
 		 215 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1081  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  26.36 
 
 		 242 aa  47.4  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0192235  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3445  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  43.55 
 
 		 270 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.423175 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2702  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  42.86 
 
 		 266 aa  47  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12835  hypothetical protein  29.23 
 
 		 236 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1754  hypothetical protein  30 
 
 		 233 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1347  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  48.08 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1859  hypothetical protein  29.12 
 
 		 594 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3258  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  30.08 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1285  CRISPR-associated RAMP Cmr4 family protein family protein  50 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0121106 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2452  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  37.29 
 
 		 285 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.673102  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2477  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  38.98 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1635  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  43.33 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000227023  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0138  protein of unknown function DUF324  22.73 
 
 		 474 aa  43.5  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1117  CRISPR-associated RAMP Cmr4 family protein family protein  52.08 
 
 		 308 aa  43.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.163915  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2459  CRISPR-associated Cmr4 family protein  37.5 
 
 		 214 aa  43.1  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00633157  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2351  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  39.53 
 
 		 269 aa  42.7  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>