49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2824 on replicon NC_013502
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013502  Rmar_2824  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  100 
 
 		 264 aa  547  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1672  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  44 
 
 		 269 aa  169  5e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.899552  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1629  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  45.54 
 
 		 215 aa  168  8e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1390  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  43.69 
 
 		 242 aa  168  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1011  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  41.63 
 
 		 247 aa  161  9e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1095  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  41.63 
 
 		 247 aa  161  9e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0610  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  43.38 
 
 		 249 aa  158  8e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1026  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  39.74 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000281722  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2477  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  42.86 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2702  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  42.11 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0975  hypothetical protein  43.84 
 
 		 220 aa  150  3e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0171126  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1081  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  44.33 
 
 		 242 aa  148  8e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0192235  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3445  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  41.01 
 
 		 270 aa  145  9e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.423175 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1754  hypothetical protein  43.81 
 
 		 233 aa  145  9e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1979  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  37.88 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2459  CRISPR-associated Cmr4 family protein  43.88 
 
 		 214 aa  136  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00633157  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1635  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  41.67 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000227023  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1254  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  37.79 
 
 		 244 aa  133  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320437 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0217  Csm3 family CRISPR-associated RAMP protein  39.45 
 
 		 224 aa  132  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0701  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  39.35 
 
 		 225 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.490218  hitchhiker  0.00485389 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0742  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  38.5 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1347  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  39.91 
 
 		 241 aa  129  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2452  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  34.8 
 
 		 285 aa  126  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.673102  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3258  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  36.04 
 
 		 251 aa  125  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12835  hypothetical protein  38.86 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2048  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  34.78 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1364  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  30.04 
 
 		 331 aa  93.2  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.152011  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1149  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  31.85 
 
 		 307 aa  90.9  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.19173  hitchhiker  0.000019358 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1544  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  27.72 
 
 		 329 aa  77.4  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.352642  normal  0.26892 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1356  hypothetical protein  35.42 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.278075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0740  hypothetical protein  27.88 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0101279  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0984  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  24.5 
 
 		 274 aa  52.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2690  CRISPR-associated RAMP Cmr4 family protein family protein  52.17 
 
 		 283 aa  49.3  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1442  CRISPR-associated Csm3 family protein  26.61 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141545 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2051  CRISPR-associated Csm3 family protein  24.18 
 
 		 260 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0981  protein of unknown function DUF324  26.85 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0365  CRISPR-associated Csm3 family protein  38.46 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395983 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2351  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  35.11 
 
 		 269 aa  47  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0188  CRISPR-associated Csm3 family protein  35.14 
 
 		 288 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1949  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  40.38 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0316  CRISPR-associated RAMP Cmr4 family protein family protein  28.72 
 
 		 324 aa  43.9  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.157396  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0697  CRISPR-associated RAMP Cmr4 family protein family protein  45.65 
 
 		 293 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1820  CRISPR-associated RAMP Cmr4 family protein family protein  37.18 
 
 		 288 aa  43.5  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303143  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5586  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  37.33 
 
 		 280 aa  43.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.199853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1985  CRISPR-associated Cmr4 family protein  40 
 
 		 233 aa  42.7  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.934081 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1514  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  45.28 
 
 		 282 aa  42.7  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0589166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0806  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  29.29 
 
 		 367 aa  42.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1989  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  35.85 
 
 		 332 aa  42.4  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.48391 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0576  CRISPR-associated RAMP Cmr4 family protein family protein  39.13 
 
 		 278 aa  42  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>