43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1754 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1754  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  482  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0975  hypothetical protein  54.77 
 
 		 220 aa  202  3e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0171126  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12835  hypothetical protein  45.99 
 
 		 236 aa  184  9e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2459  CRISPR-associated Cmr4 family protein  48.33 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00633157  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1095  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  40.38 
 
 		 247 aa  146  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1011  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  40.38 
 
 		 247 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2824  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  43.81 
 
 		 264 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2452  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  34.93 
 
 		 285 aa  134  9e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.673102  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2477  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  35.24 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0701  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  38.89 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.490218  hitchhiker  0.00485389 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0610  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  37.62 
 
 		 249 aa  123  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0217  Csm3 family CRISPR-associated RAMP protein  40.47 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1026  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  35.06 
 
 		 272 aa  122  6e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000281722  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1672  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  39.08 
 
 		 269 aa  122  6e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.899552  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1254  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  38.43 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320437 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2702  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  35.44 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1390  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  37.21 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3445  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  33.92 
 
 		 270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.423175 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1081  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  37.62 
 
 		 242 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0192235  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1979  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  34.19 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3258  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  35.62 
 
 		 251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1629  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  35.24 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1635  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  36.02 
 
 		 264 aa  101  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000227023  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0742  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  36.41 
 
 		 242 aa  95.9  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2048  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  29.84 
 
 		 285 aa  94.7  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1347  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  36.45 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1544  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  32.71 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.352642  normal  0.26892 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1364  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  43.43 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.152011  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1149  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  29.72 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.19173  hitchhiker  0.000019358 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0931  protein of unknown function DUF324  27.18 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0413017  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0962  CRISPR-associated RAMP Cmr4 family protein  29.65 
 
 		 264 aa  51.6  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.60167  normal  0.960375 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0740  hypothetical protein  27.07 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0101279  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0365  CRISPR-associated Csm3 family protein  30 
 
 		 289 aa  45.4  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395983 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0188  CRISPR-associated Csm3 family protein  31.25 
 
 		 288 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2295  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  35.48 
 
 		 297 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1987  protein of unknown function DUF324  25.99 
 
 		 359 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.920046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1949  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  48.84 
 
 		 298 aa  43.9  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3447  CRISPR-associated RAMP protein, Csm5 family  34.57 
 
 		 471 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.186008 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1820  CRISPR-associated RAMP Cmr4 family protein family protein  31.58 
 
 		 288 aa  43.5  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303143  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2351  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  45.65 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2390  SSO1426 family CRISPR-associated RAMP protein  37.04 
 
 		 299 aa  42.7  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.293028  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5586  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  26.01 
 
 		 280 aa  42.4  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.199853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2690  CRISPR-associated RAMP Cmr4 family protein family protein  26.75 
 
 		 283 aa  42  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>