41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0975 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0975  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  441  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0171126  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12835  hypothetical protein  47.37 
 
 		 236 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1754  hypothetical protein  54.77 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2459  CRISPR-associated Cmr4 family protein  50 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00633157  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1095  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  44.83 
 
 		 247 aa  158  7e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1011  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  44.83 
 
 		 247 aa  158  8e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2824  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  43.84 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1254  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  42.52 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320437 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1081  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  45.1 
 
 		 242 aa  141  9e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0192235  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1629  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  42.29 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1390  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  44.55 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0610  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  39.19 
 
 		 249 aa  138  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3445  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  40.47 
 
 		 270 aa  131  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.423175 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2452  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  37.02 
 
 		 285 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.673102  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2477  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  39.81 
 
 		 255 aa  130  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0701  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  40.1 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.490218  hitchhiker  0.00485389 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1635  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  39.81 
 
 		 264 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000227023  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3258  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  41.01 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0217  Csm3 family CRISPR-associated RAMP protein  39.41 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1979  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  38.33 
 
 		 278 aa  119  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206757 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1672  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  39.91 
 
 		 269 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.899552  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1026  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  35.84 
 
 		 272 aa  117  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000281722  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2048  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  35.54 
 
 		 285 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2702  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  40.09 
 
 		 266 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0742  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  41.86 
 
 		 242 aa  108  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1347  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  40.85 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1544  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  25.09 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.352642  normal  0.26892 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1149  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  31.8 
 
 		 307 aa  71.6  0.000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.19173  hitchhiker  0.000019358 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1364  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  41.18 
 
 		 331 aa  68.9  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.152011  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1442  CRISPR-associated Csm3 family protein  26.1 
 
 		 267 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1354  hypothetical protein  28.09 
 
 		 364 aa  52.8  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00474822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1987  protein of unknown function DUF324  30.17 
 
 		 359 aa  51.2  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.920046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1949  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  28.9 
 
 		 298 aa  50.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1989  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  41.94 
 
 		 332 aa  47.8  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.48391 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2690  CRISPR-associated RAMP Cmr4 family protein family protein  29.06 
 
 		 283 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4242  hypothetical protein  23.56 
 
 		 439 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.339466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0915  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  42 
 
 		 354 aa  45.4  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.994799  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0740  hypothetical protein  26.47 
 
 		 257 aa  44.3  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0101279  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3812  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr4 family  42.86 
 
 		 449 aa  42.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.458595 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4240  CRISPR-associated RAMP Cmr4 family protein family protein  33.9 
 
 		 328 aa  41.6  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.400432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2589  CRISPR-associated RAMP Cmr4 family protein family protein  32.2 
 
 		 330 aa  41.6  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.598353  normal  0.467768 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>