53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5586 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5586  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  100 
 
 		 280 aa  562  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.199853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1442  CRISPR-associated Csm3 family protein  38.37 
 
 		 267 aa  152  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141545 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1801  CRISPR-associated Csm3 family protein  38.27 
 
 		 282 aa  125  8.000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0984  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  36.73 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0188  CRISPR-associated Csm3 family protein  36.56 
 
 		 288 aa  122  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0365  CRISPR-associated Csm3 family protein  35.22 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395983 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2390  SSO1426 family CRISPR-associated RAMP protein  32.72 
 
 		 299 aa  112  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.293028  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2051  CRISPR-associated Csm3 family protein  30.71 
 
 		 260 aa  109  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2050  CRISPR-associated Csm3 family protein  28.7 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0740  hypothetical protein  29.6 
 
 		 257 aa  95.5  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0101279  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5587  protein of unknown function DUF324  33.33 
 
 		 315 aa  88.2  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1800  hypothetical protein  34.11 
 
 		 299 aa  87.4  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1288  CRISPR-associated Csm3 family protein  29.44 
 
 		 307 aa  85.5  8e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0685165  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1443  hypothetical protein  33.79 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0712178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1859  hypothetical protein  29.91 
 
 		 594 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1160  CRISPR-associated Csx7 family protein  30.81 
 
 		 254 aa  78.6  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.791227  normal  0.0434649 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1070  protein of unknown function DUF324  29.05 
 
 		 597 aa  77  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2392  hypothetical protein  30.09 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.556583  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0985  protein of unknown function DUF324  34.44 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1161  CRISPR-associated Csx7 family protein  28.19 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.59336  hitchhiker  0.00757758 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3292  hypothetical protein  27.23 
 
 		 622 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.798448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0364  hypothetical protein  29.3 
 
 		 354 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389442 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0981  protein of unknown function DUF324  30.39 
 
 		 237 aa  67  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1081  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  28.69 
 
 		 242 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0192235  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2385  hypothetical protein  29.06 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0187  hypothetical protein  30.77 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1287  CRISPR-associated Csm3 family protein  29.55 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.609283  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1804  hypothetical protein  30.2 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2526  hypothetical protein  24.09 
 
 		 504 aa  61.6  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0739  hypothetical protein  24.78 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0138  protein of unknown function DUF324  21.82 
 
 		 474 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1095  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  25.28 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1011  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  24.91 
 
 		 247 aa  53.9  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1918  hypothetical protein  27.27 
 
 		 513 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1254  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  26.34 
 
 		 244 aa  53.1  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320437 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1834  hypothetical protein  22.92 
 
 		 472 aa  52.8  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1293  hypothetical protein  27.75 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1629  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  23.65 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0610  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  25.11 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1376  hypothetical protein  27.83 
 
 		 576 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20530  uncharacterized RAMP superfamily protein probably involved in DNA repair  28.93 
 
 		 415 aa  49.7  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1672  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  23.45 
 
 		 269 aa  49.7  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.899552  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2452  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  24.51 
 
 		 285 aa  48.5  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.673102  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1007  hypothetical protein  27.57 
 
 		 558 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0184  hypothetical protein  27.49 
 
 		 548 aa  46.6  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2702  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  27.12 
 
 		 266 aa  45.8  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2048  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  23.35 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2054  hypothetical protein  23.12 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1026  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  22.34 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000281722  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1164  hypothetical protein  25.29 
 
 		 211 aa  44.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00846992 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2824  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  37.33 
 
 		 264 aa  43.5  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1390  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  21.22 
 
 		 242 aa  43.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1754  hypothetical protein  26.01 
 
 		 233 aa  42.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>