57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0984 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0984  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  100 
 
 		 274 aa  550  1e-156  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1801  CRISPR-associated Csm3 family protein  58.55 
 
 		 282 aa  325  5e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1442  CRISPR-associated Csm3 family protein  36.8 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141545 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2051  CRISPR-associated Csm3 family protein  34.62 
 
 		 260 aa  141  9e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0188  CRISPR-associated Csm3 family protein  36.48 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0365  CRISPR-associated Csm3 family protein  35.93 
 
 		 289 aa  125  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00395983 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5586  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  36.73 
 
 		 280 aa  123  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.199853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2390  SSO1426 family CRISPR-associated RAMP protein  37.15 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.293028  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1288  CRISPR-associated Csm3 family protein  35 
 
 		 307 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0685165  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0985  protein of unknown function DUF324  38.86 
 
 		 298 aa  119  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5587  protein of unknown function DUF324  36.1 
 
 		 315 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1800  hypothetical protein  32.74 
 
 		 299 aa  97.1  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2050  CRISPR-associated Csm3 family protein  29.61 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0739  hypothetical protein  27.34 
 
 		 429 aa  94  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.187894 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1070  protein of unknown function DUF324  33.98 
 
 		 597 aa  90.5  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3292  hypothetical protein  32.03 
 
 		 622 aa  89  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.798448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1443  hypothetical protein  30.71 
 
 		 294 aa  86.3  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0712178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1859  hypothetical protein  35.43 
 
 		 594 aa  85.5  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0740  hypothetical protein  35.14 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0101279  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1161  CRISPR-associated Csx7 family protein  30.57 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.59336  hitchhiker  0.00757758 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2392  hypothetical protein  30.48 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.556583  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1160  CRISPR-associated Csx7 family protein  29.91 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.791227  normal  0.0434649 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0364  hypothetical protein  31.92 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389442 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1287  CRISPR-associated Csm3 family protein  32.3 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.609283  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0981  protein of unknown function DUF324  31.67 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1804  hypothetical protein  34.54 
 
 		 240 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0610  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  25.1 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1918  hypothetical protein  30.87 
 
 		 513 aa  66.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1629  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  25 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1095  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  27.39 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0187  hypothetical protein  34.33 
 
 		 355 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1011  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  26.97 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1445  hypothetical protein  27.06 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696402 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0138  protein of unknown function DUF324  27.41 
 
 		 474 aa  57  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1081  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  27.31 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0192235  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2385  hypothetical protein  23.87 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2526  hypothetical protein  27.59 
 
 		 504 aa  55.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2452  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  27.05 
 
 		 285 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.673102  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20530  uncharacterized RAMP superfamily protein probably involved in DNA repair  28.82 
 
 		 415 aa  52.8  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2824  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  24.5 
 
 		 264 aa  52.8  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1007  hypothetical protein  27.51 
 
 		 558 aa  52.4  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5588  protein of unknown function DUF324  27.59 
 
 		 331 aa  52.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3258  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  29.84 
 
 		 251 aa  52.4  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1834  hypothetical protein  23.83 
 
 		 472 aa  50.4  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1026  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  25.91 
 
 		 272 aa  48.9  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000281722  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0742  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  37.08 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2702  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  23.17 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1390  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  24.69 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1162  hypothetical protein  31.48 
 
 		 275 aa  46.2  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00757758 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2477  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  38.98 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2048  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  25.53 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0744  hypothetical protein  25.76 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0162344  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1672  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  23.4 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.899552  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1293  hypothetical protein  24.27 
 
 		 288 aa  43.9  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1376  hypothetical protein  29.89 
 
 		 576 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1347  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  37.66 
 
 		 241 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1254  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  24.14 
 
 		 244 aa  42.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320437 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>