23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1445 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1445  hypothetical protein  100 
 
 		 330 aa  678    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0696402 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0987  protein of unknown function DUF324  31.33 
 
 		 331 aa  102  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1798  putative CRISPR-associated RAMP family protein  34.38 
 
 		 339 aa  99.8  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0362  hypothetical protein  32.29 
 
 		 321 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0158  hypothetical protein  31.51 
 
 		 390 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.59719 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0185  hypothetical protein  32.75 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2394  hypothetical protein  24.54 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.621441  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1162  hypothetical protein  26.42 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00757758 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2049  hypothetical protein  24.86 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0984  CRISPR-associated RAMP protein, SSO1426 family  27.06 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1857  hypothetical protein  35.05 
 
 		 711 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1856  hypothetical protein  32.18 
 
 		 712 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5588  protein of unknown function DUF324  29.73 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2050  CRISPR-associated Csm3 family protein  25.68 
 
 		 279 aa  53.9  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1068  hypothetical protein  31.76 
 
 		 698 aa  53.1  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3290  hypothetical protein  31.76 
 
 		 699 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1289  hypothetical protein  25.1 
 
 		 332 aa  52.4  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.505534  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1065  hypothetical protein  28.41 
 
 		 698 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3289  hypothetical protein  28.41 
 
 		 699 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1443  hypothetical protein  28.12 
 
 		 294 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0712178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1442  CRISPR-associated Csm3 family protein  29.55 
 
 		 267 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141545 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0985  protein of unknown function DUF324  25.69 
 
 		 298 aa  43.9  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1800  hypothetical protein  27.23 
 
 		 299 aa  43.1  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>