21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0987 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0987  protein of unknown function DUF324  100 
 
 
331 aa  677    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1798  putative CRISPR-associated RAMP family protein  49.85 
 
 
339 aa  333  3e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0362  hypothetical protein  32.92 
 
 
321 aa  123  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2394  hypothetical protein  29.35 
 
 
357 aa  113  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.621441  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0158  hypothetical protein  28.14 
 
 
390 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.59719 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1445  hypothetical protein  31.33 
 
 
330 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0696402 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0185  hypothetical protein  34.63 
 
 
319 aa  100  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3290  hypothetical protein  27.95 
 
 
699 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2049  hypothetical protein  25.86 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1068  hypothetical protein  25.99 
 
 
698 aa  67  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5588  protein of unknown function DUF324  27.88 
 
 
331 aa  63.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1857  hypothetical protein  25.39 
 
 
711 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1920  hypothetical protein  30.28 
 
 
719 aa  49.3  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1065  hypothetical protein  28.46 
 
 
698 aa  48.5  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3289  hypothetical protein  27.64 
 
 
699 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1856  hypothetical protein  29.66 
 
 
712 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.121377  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1832  hypothetical protein  28.07 
 
 
666 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1011  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  30.39 
 
 
247 aa  44.3  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1374  hypothetical protein  25.31 
 
 
756 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1095  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  30.39 
 
 
247 aa  44.3  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20490  uncharacterized RAMP superfamily protein probably involved in DNA repair  23.53 
 
 
670 aa  43.1  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>