16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1008 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1008  hypothetical protein  100 
 
 		 808 aa  1575    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1377  hypothetical protein  31.67 
 
 		 819 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1071  protein of unknown function DUF324  25.15 
 
 		 778 aa  96.3  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3293  hypothetical protein  24.96 
 
 		 776 aa  88.2  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.642367  normal  0.855999 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0137  protein of unknown function DUF324  22.14 
 
 		 757 aa  84.7  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1835  hypothetical protein  19.28 
 
 		 738 aa  76.6  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2527  hypothetical protein  20.71 
 
 		 791 aa  70.5  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1916  hypothetical protein  28.76 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1917  CRISPR-associated RAMP Csx10 family protein  31.75 
 
 		 526 aa  65.1  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1860  hypothetical protein  22.44 
 
 		 821 aa  61.2  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.441776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0191  hypothetical protein  30.23 
 
 		 214 aa  52  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.667263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1803  CRISPR-associated RAMP Csx10 family protein  37.3 
 
 		 423 aa  51.2  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3211  hypothetical protein  23.89 
 
 		 533 aa  46.2  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0368  hypothetical protein  27.71 
 
 		 217 aa  46.2  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100802 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2386  Csx10 family CRISPR-associated RAMP protein  35.23 
 
 		 426 aa  45.4  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0190  hypothetical protein  35.51 
 
 		 391 aa  45.4  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.374414  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>