243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2023 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2023  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
277 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0047774  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1072  MotA/TolQ/ExbB proton channel  70.07 
 
 
274 aa  397  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.433841  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2075  MotA/TolQ/ExbB proton channel  60.29 
 
 
277 aa  347  1e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.921977  normal  0.338656 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2017  MotA/TolQ/ExbB proton channel  59.61 
 
 
301 aa  330  2e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27650  flagellar motor protein  56.03 
 
 
273 aa  315  5e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133269  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1684  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.73 
 
 
272 aa  314  9e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.01 
 
 
299 aa  301  7.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1402  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.66 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.462015  normal  0.61336 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16780  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.45 
 
 
267 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000859777  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.53 
 
 
252 aa  159  4e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000718069  normal  0.214195 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1717  chemotaxis protein PomA  34.41 
 
 
251 aa  156  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.690132  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2425  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.23 
 
 
279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000186684  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.77 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.822271 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3589  chemotaxis protein MotA  36.07 
 
 
254 aa  145  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1538  chemotaxis protein MotA  35.66 
 
 
251 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371855  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0358  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.58 
 
 
275 aa  142  7e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2319  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.85 
 
 
250 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.213848  hitchhiker  0.00117076 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1535  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.79 
 
 
262 aa  136  4e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.91 
 
 
251 aa  135  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1745  flagellar motor protein  29.57 
 
 
257 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0253  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.47 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0255  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.47 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1745  flagellar motor protein  29.18 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1397  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.6 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9942  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.95 
 
 
255 aa  130  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.572139  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1295  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.8 
 
 
262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.02 
 
 
277 aa  129  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163416  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0287  chemotaxis protein MotA (Motility protein A)  31.58 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0314  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.2 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0820  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.17 
 
 
251 aa  126  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3219  flagellar motor protein PomA  29.92 
 
 
253 aa  125  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1012  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.58 
 
 
253 aa  125  9e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1172  proton conductor component of motor; no effect on switching  28.23 
 
 
257 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.75 
 
 
262 aa  125  1e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0781  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.78 
 
 
272 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00147223  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.55 
 
 
265 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2078  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.46 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.174751  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4079  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.21 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3364  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.14 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0112135 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2766  motility protein A  29.34 
 
 
259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000892451  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0653  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.29 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000451505 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2706  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.54 
 
 
266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.76 
 
 
257 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362877  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.89 
 
 
251 aa  119  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0447441  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0233  flagellar motor protein MotA  28.52 
 
 
253 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.961919  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1875  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.52 
 
 
253 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0131395  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0461  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.11 
 
 
254 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3905  flagellar motor protein  31.43 
 
 
246 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.448269  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1322  flagellar motor protein PomA  30.23 
 
 
254 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1236  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.59 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.894352  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.16 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210731  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1495  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.42 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00626739  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3326  flagellar motor protein PomA  30.27 
 
 
255 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.582531  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004255  Flagellar motor rotation protein MotA  27.73 
 
 
253 aa  116  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.762495  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0987  flagellar motor protein MotA  27.99 
 
 
263 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0578  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.28 
 
 
261 aa  117  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0355  flagellar motor protein MotA  26.3 
 
 
268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.14 
 
 
260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3836  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.67 
 
 
254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0179071 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1299  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.02 
 
 
255 aa  115  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.458392  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01428  flagellar motor protein PomA  29.3 
 
 
253 aa  115  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.17 
 
 
257 aa  115  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0425767  normal  0.0158705 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4336  flagellar motor protein  31.02 
 
 
246 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0869231  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01176  flagellar motor protein PomA  27.73 
 
 
253 aa  115  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3027  chemotaxis MotA protein  26.51 
 
 
254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1531  flagellar motor protein  30.61 
 
 
246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270936  normal  0.422767 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2988  flagellar motor protein PomA  27.8 
 
 
255 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.924494  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.27 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.72 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1015  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.64 
 
 
254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.459149  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0239  hypothetical protein  31.43 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0060835  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.96 
 
 
251 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.39 
 
 
262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3475  flagellar motor protein PomA  28.19 
 
 
255 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113278  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.94 
 
 
259 aa  112  5e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000377193  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1314  flagellar motor protein  30.67 
 
 
246 aa  112  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.55 
 
 
272 aa  112  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2100  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.38 
 
 
257 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1945  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.07 
 
 
250 aa  112  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118211  normal  0.790191 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2768  flagellar motor protein PomA  27.41 
 
 
255 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2787  flagellar motor protein PomA  26.67 
 
 
255 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.315605  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3510  putative chemotaxis protein MotA (flagellar motor component)  28.74 
 
 
257 aa  112  9e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1250  flagellar motor protein  30.59 
 
 
245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2464  flagellar motor protein MotA  26.97 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.407079  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3662  flagellar motor protein  29.8 
 
 
246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2975  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.74 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1072  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.07 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3432  flagellar motor protein  28.57 
 
 
246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.228788  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2898  flagellar motor protein PomA  27.41 
 
 
255 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141177  hitchhiker  0.0000842214 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.4 
 
 
249 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0049  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.57 
 
 
257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969592  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1017  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.78 
 
 
263 aa  110  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1984  chemotaxis motA protein  28.57 
 
 
246 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.258638  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0338  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.25 
 
 
288 aa  109  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1858  flagellar motor protein  31.28 
 
 
246 aa  109  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.403238  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0415  flagellar motor protein PomA  27.73 
 
 
254 aa  109  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0186256  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2728  flagellar motor protein PomA  27.03 
 
 
255 aa  109  6e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00881641  normal  0.350024 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2801  flagellar motor protein PomA  27.03 
 
 
255 aa  109  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.349306  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0936  flagellar motor protein PomA  26.56 
 
 
254 aa  109  6e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0279323  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2433  flagellar motor protein PomA  27.41 
 
 
255 aa  109  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>