More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4079 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4079  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
256 aa  508  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  82.81 
 
 
254 aa  419  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3836  MotA/TolQ/ExbB proton channel  82.81 
 
 
254 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0179071 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0461  MotA/TolQ/ExbB proton channel  77.73 
 
 
254 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3027  chemotaxis MotA protein  77.25 
 
 
254 aa  393  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  75.41 
 
 
249 aa  382  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0031  MotA/TolQ/ExbB proton channel  73.36 
 
 
249 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2933  flagellar motor protein  48.57 
 
 
246 aa  261  6e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0744  flagellar motor protein  48.16 
 
 
246 aa  259  4e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3905  flagellar motor protein  49.39 
 
 
246 aa  248  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.448269  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4336  flagellar motor protein  48.98 
 
 
246 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0869231  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1314  flagellar motor protein  46.53 
 
 
246 aa  246  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1531  flagellar motor protein  48.57 
 
 
246 aa  245  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270936  normal  0.422767 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3662  flagellar motor protein  48.98 
 
 
246 aa  244  8e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2568  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.02 
 
 
261 aa  244  8e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1984  chemotaxis motA protein  48.16 
 
 
246 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.258638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3432  flagellar motor protein  47.76 
 
 
246 aa  242  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.228788  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2472  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.61 
 
 
261 aa  242  5e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1250  flagellar motor protein  44.49 
 
 
245 aa  241  9e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.2 
 
 
261 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1568  flagellar motor protein  46.75 
 
 
246 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709398  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45560  flagellar motor protein  46.53 
 
 
246 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.687243 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.49 
 
 
265 aa  230  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210731  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3866  flagellar motor protein  46.53 
 
 
246 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2800  flagellar motor protein  46.75 
 
 
246 aa  228  6e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76835  normal  0.157366 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2159  flagellar motor protein  44.9 
 
 
246 aa  226  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.193133  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2933  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.6 
 
 
255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0653  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.77 
 
 
260 aa  225  6e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000451505 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1524  chemotaxis MotA protein  45.49 
 
 
248 aa  223  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1949  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.27 
 
 
246 aa  222  4e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1970  flagellar motor protein  45.31 
 
 
246 aa  221  9e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3589  chemotaxis protein MotA  39.61 
 
 
254 aa  217  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1858  flagellar motor protein  44.9 
 
 
246 aa  216  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.403238  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.58 
 
 
257 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.49 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1072  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.4 
 
 
265 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1343  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.67 
 
 
246 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428194  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0851  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.47 
 
 
260 aa  207  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566101  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.5 
 
 
265 aa  207  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.84 
 
 
251 aa  207  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1745  flagellar motor protein  45.08 
 
 
257 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1745  flagellar motor protein  44.67 
 
 
257 aa  206  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1180  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.51 
 
 
247 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00026  flagellar motor protein  44.07 
 
 
237 aa  202  6e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142899  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.08 
 
 
277 aa  201  7e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163416  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2981  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.46 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.44999 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0239  hypothetical protein  45.78 
 
 
263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0060835  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2337  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.9 
 
 
257 aa  194  8.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.516554  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1402  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.41 
 
 
266 aa  192  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.462015  normal  0.61336 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.21 
 
 
252 aa  192  5e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.822271 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.04 
 
 
272 aa  191  7e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.11 
 
 
262 aa  191  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16780  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.65 
 
 
267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000859777  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2425  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.59 
 
 
279 aa  189  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000186684  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0578  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.02 
 
 
261 aa  187  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2017  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.18 
 
 
261 aa  184  9e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.358452  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0355  flagellar motor protein MotA  37.89 
 
 
268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0614  flagellar motor protein MotA  38.52 
 
 
264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1172  proton conductor component of motor; no effect on switching  36.82 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.08 
 
 
265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.19 
 
 
267 aa  183  3e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1717  chemotaxis protein PomA  37.01 
 
 
251 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.690132  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31120  flagellar motor component  38.02 
 
 
253 aa  181  8.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229766  normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4287  chemotaxis motA protein  39.26 
 
 
244 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1295  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.4 
 
 
262 aa  180  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0264  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.69 
 
 
266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2898  flagellar motor protein PomA  37.25 
 
 
255 aa  175  5e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141177  hitchhiker  0.0000842214 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2706  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.5 
 
 
266 aa  175  5e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1346  flagellar motor protein PomA  36.44 
 
 
255 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1360  flagellar motor protein PomA  36.44 
 
 
255 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0076192  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1385  flagellar motor protein PomA  36.44 
 
 
255 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3787  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.68 
 
 
254 aa  175  8e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146883  normal  0.0197098 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3000  flagellar motor protein PomA  36.44 
 
 
255 aa  175  8e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0822538  decreased coverage  0.0000000757228 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2359  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.68 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4630  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.27 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.220987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3734  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.27 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0165356 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0253  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.65 
 
 
262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0255  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.65 
 
 
262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5469  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.27 
 
 
254 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1376  putative flagellar motor protein (MotA)  34.85 
 
 
254 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.73 
 
 
259 aa  172  6.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000377193  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4621  flagellar motor protein MotA  38.93 
 
 
264 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4599  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.85 
 
 
254 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.666334  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1535  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.22 
 
 
262 aa  171  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1529  flagellar motor protein PomA  36.44 
 
 
255 aa  170  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0833  flagellar motor protein PomA  36.33 
 
 
256 aa  170  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0987  flagellar motor protein MotA  36.4 
 
 
263 aa  169  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3616  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.27 
 
 
254 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.593403  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2768  flagellar motor protein PomA  35.22 
 
 
255 aa  169  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2728  flagellar motor protein PomA  35.63 
 
 
255 aa  169  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00881641  normal  0.350024 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2801  flagellar motor protein PomA  35.63 
 
 
255 aa  169  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.349306  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.07 
 
 
252 aa  168  7e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000718069  normal  0.214195 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4999  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.85 
 
 
254 aa  168  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.567523 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1278  flagellar motor protein PomA  36.03 
 
 
255 aa  167  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.398192  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0781  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.65 
 
 
272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00147223  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1740  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.91 
 
 
253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.793002 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3326  flagellar motor protein PomA  35.22 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.582531  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0968  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.29 
 
 
256 aa  166  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2568  flagellar motor protein PomA  34.82 
 
 
255 aa  165  8e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.642903  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2766  motility protein A  34.94 
 
 
259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000892451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>