More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3662 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3662  flagellar motor protein  100 
 
 
246 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1531  flagellar motor protein  98.37 
 
 
246 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270936  normal  0.422767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4336  flagellar motor protein  97.56 
 
 
246 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0869231  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3905  flagellar motor protein  96.75 
 
 
246 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.448269  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1568  flagellar motor protein  89.43 
 
 
246 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709398  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1984  chemotaxis motA protein  88.21 
 
 
246 aa  434  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.258638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3432  flagellar motor protein  87.8 
 
 
246 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.228788  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2800  flagellar motor protein  83.74 
 
 
246 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76835  normal  0.157366 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3866  flagellar motor protein  83.74 
 
 
246 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45560  flagellar motor protein  83.33 
 
 
246 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.687243 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1970  flagellar motor protein  64.23 
 
 
246 aa  332  2e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2159  flagellar motor protein  61.79 
 
 
246 aa  326  2.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.193133  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1343  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.27 
 
 
246 aa  310  2e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428194  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1180  MotA/TolQ/ExbB proton channel  60.57 
 
 
247 aa  293  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1858  flagellar motor protein  56.5 
 
 
246 aa  281  6.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.403238  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0744  flagellar motor protein  55.28 
 
 
246 aa  271  8.000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00026  flagellar motor protein  55.7 
 
 
237 aa  262  4e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142899  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1524  chemotaxis MotA protein  52.05 
 
 
248 aa  259  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2933  flagellar motor protein  53.06 
 
 
246 aa  257  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1745  flagellar motor protein  52.87 
 
 
257 aa  256  2e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1314  flagellar motor protein  53.06 
 
 
246 aa  256  2e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1745  flagellar motor protein  52.46 
 
 
257 aa  255  4e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1250  flagellar motor protein  53.06 
 
 
245 aa  253  3e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4079  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.98 
 
 
256 aa  244  8e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0461  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.93 
 
 
254 aa  233  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1949  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.78 
 
 
246 aa  232  5e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.75 
 
 
254 aa  229  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0031  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.31 
 
 
249 aa  228  7e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3027  chemotaxis MotA protein  45.93 
 
 
254 aa  227  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.72 
 
 
249 aa  227  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3836  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.75 
 
 
254 aa  227  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0179071 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4287  chemotaxis motA protein  46.09 
 
 
244 aa  214  8e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2472  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.95 
 
 
261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2568  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.54 
 
 
261 aa  211  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.72 
 
 
261 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1072  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.53 
 
 
265 aa  202  5e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.68 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.54 
 
 
265 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210731  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0653  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.22 
 
 
260 aa  192  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000451505 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.63 
 
 
265 aa  190  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3423  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.93 
 
 
245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.21 
 
 
277 aa  188  7e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163416  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4999  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.39 
 
 
254 aa  186  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.567523 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1376  putative flagellar motor protein (MotA)  39.51 
 
 
254 aa  186  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.22 
 
 
265 aa  186  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4599  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.33 
 
 
254 aa  185  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.666334  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1402  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.41 
 
 
266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.462015  normal  0.61336 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3787  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.74 
 
 
254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146883  normal  0.0197098 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4630  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.33 
 
 
254 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.220987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3734  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.33 
 
 
254 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0165356 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2359  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.74 
 
 
254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.412046  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2933  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.42 
 
 
255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.98 
 
 
257 aa  181  7e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5469  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.8 
 
 
254 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3589  chemotaxis protein MotA  38.11 
 
 
254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.41 
 
 
262 aa  178  7e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.65 
 
 
252 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.822271 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3616  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.98 
 
 
254 aa  176  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.593403  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0968  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.62 
 
 
256 aa  175  5e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1295  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.18 
 
 
262 aa  175  6e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2337  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.41 
 
 
257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.516554  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.55 
 
 
272 aa  171  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0239  hypothetical protein  40.27 
 
 
263 aa  171  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0060835  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.96 
 
 
267 aa  169  4e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16780  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.78 
 
 
267 aa  169  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000859777  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0851  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.59 
 
 
260 aa  168  6e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566101  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.39 
 
 
252 aa  168  7e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000718069  normal  0.214195 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0355  flagellar motor protein MotA  37.19 
 
 
268 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1269  chemotaxis protein PomA  34.69 
 
 
254 aa  165  5e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.942425  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1535  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.03 
 
 
262 aa  165  8e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.95 
 
 
251 aa  164  9e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0987  flagellar motor protein MotA  37.75 
 
 
263 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2017  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.43 
 
 
261 aa  163  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.358452  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0264  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.27 
 
 
266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0749  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.59 
 
 
255 aa  158  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0614  flagellar motor protein MotA  36.44 
 
 
264 aa  158  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2706  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.5 
 
 
266 aa  157  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2981  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.32 
 
 
276 aa  157  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.44999 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1172  proton conductor component of motor; no effect on switching  33.2 
 
 
257 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1717  chemotaxis protein PomA  33.06 
 
 
251 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.690132  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2425  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.29 
 
 
279 aa  155  6e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000186684  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0253  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.1 
 
 
262 aa  154  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0255  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.1 
 
 
262 aa  154  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1740  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.32 
 
 
253 aa  153  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.793002 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31120  flagellar motor component  37.08 
 
 
253 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229766  normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0691  permease  34.15 
 
 
255 aa  152  4e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0494  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.96 
 
 
272 aa  152  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.868711  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
262 aa  148  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2464  flagellar motor protein MotA  34.96 
 
 
263 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.407079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4621  flagellar motor protein MotA  36.44 
 
 
264 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1015  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.47 
 
 
254 aa  145  5e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.459149  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.29 
 
 
251 aa  145  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0447441  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0578  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.06 
 
 
261 aa  145  6e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0834  flagellar motor protein MotA  35.27 
 
 
253 aa  143  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1012  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.06 
 
 
253 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1660  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.96 
 
 
257 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0633  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.31 
 
 
244 aa  140  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00732612  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0233  flagellar motor protein MotA  35.71 
 
 
253 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.961919  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1875  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.71 
 
 
253 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0131395  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0314  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.29 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>