More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1172 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1172  proton conductor component of motor; no effect on switching  100 
 
 		 257 aa  522  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0578  MotA/TolQ/ExbB proton channel  56.42 
 
 		 261 aa  308  6.999999999999999e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3589  chemotaxis protein MotA  53.94 
 
 		 254 aa  285  4e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.8 
 
 		 251 aa  270  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.62 
 
 		 252 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.822271 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.83 
 
 		 252 aa  240  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000718069  normal  0.214195 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1717  chemotaxis protein PomA  45.82 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.690132  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1402  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.18 
 
 		 266 aa  231  8.000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.462015  normal  0.61336 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16780  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.32 
 
 		 267 aa  225  7e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000859777  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2319  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.18 
 
 		 250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.213848  hitchhiker  0.00117076 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1945  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.02 
 
 		 250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118211  normal  0.790191 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.78 
 
 		 262 aa  218  5e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0691  permease  45.31 
 
 		 255 aa  216  2e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3326  flagellar motor protein PomA  44.8 
 
 		 255 aa  216  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.582531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1269  chemotaxis protein PomA  46.06 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.942425  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2988  flagellar motor protein PomA  44.8 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.924494  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0781  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.47 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2425  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.08 
 
 		 279 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000186684  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2433  flagellar motor protein PomA  43.6 
 
 		 255 aa  211  9e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1295  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.13 
 
 		 262 aa  209  3e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2787  flagellar motor protein PomA  44.8 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.315605  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2768  flagellar motor protein PomA  44 
 
 		 255 aa  209  5e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0833  flagellar motor protein PomA  43.58 
 
 		 256 aa  208  9e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3000  flagellar motor protein PomA  42.4 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0822538  decreased coverage  0.0000000757228 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1012  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.63 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0314  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.46 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1322  flagellar motor protein PomA  42.63 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2898  flagellar motor protein PomA  42 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141177  hitchhiker  0.0000842214 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0936  flagellar motor protein PomA  42.19 
 
 		 254 aa  206  4e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0279323  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01428  flagellar motor protein PomA  43.43 
 
 		 253 aa  206  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3475  flagellar motor protein PomA  42 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113278  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1385  flagellar motor protein PomA  41.6 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1346  flagellar motor protein PomA  41.6 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1015  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.29 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.459149  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1360  flagellar motor protein PomA  41.6 
 
 		 255 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0076192  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1092  flagellar motor protein PomA  43.2 
 
 		 254 aa  202  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3219  flagellar motor protein PomA  42 
 
 		 253 aa  202  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004255  Flagellar motor rotation protein MotA  41.37 
 
 		 253 aa  202  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.762495  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2568  flagellar motor protein PomA  42 
 
 		 255 aa  202  5e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.642903  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2728  flagellar motor protein PomA  42 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00881641  normal  0.350024 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2801  flagellar motor protein PomA  42 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.349306  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1299  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 		 255 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.458392  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01176  flagellar motor protein PomA  40.96 
 
 		 253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.37 
 
 		 251 aa  198  7e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0447441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1535  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.55 
 
 		 262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1529  flagellar motor protein PomA  40.8 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1278  flagellar motor protein PomA  40.8 
 
 		 255 aa  195  6e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.398192  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0253  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.11 
 
 		 262 aa  194  9e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0255  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.11 
 
 		 262 aa  194  9e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2706  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.78 
 
 		 266 aa  192  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0415  flagellar motor protein PomA  41.77 
 
 		 254 aa  192  5e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0186256  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1394  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.19 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.15 
 
 		 265 aa  192  6e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210731  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0461  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.65 
 
 		 254 aa  191  8e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1397  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.16 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9942  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0820  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.8 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1538  chemotaxis protein MotA  39.44 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371855  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.25 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0653  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.4 
 
 		 260 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000451505 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1875  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.62 
 
 		 253 aa  185  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0131395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0233  flagellar motor protein MotA  40.62 
 
 		 253 aa  185  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.961919  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3027  chemotaxis MotA protein  38.37 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0049  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.25 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969592  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4079  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.82 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.25 
 
 		 260 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0541  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.84 
 
 		 272 aa  182  6e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.72 
 
 		 267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.89 
 
 		 249 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0031  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.3 
 
 		 249 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3836  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.95 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0179071 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.55 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0287  chemotaxis protein MotA (Motility protein A)  36.68 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0851  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.87 
 
 		 260 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.51 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000377193  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1314  flagellar motor protein  34.29 
 
 		 246 aa  169  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0338  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.55 
 
 		 288 aa  168  8e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1660  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.14 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.36 
 
 		 261 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2568  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.36 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2337  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.68 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.516554  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2472  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.36 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.92 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3510  putative chemotaxis protein MotA (flagellar motor component)  35.32 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1017  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.11 
 
 		 263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.03 
 
 		 277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2078  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.25 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.174751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0239  hypothetical protein  38.1 
 
 		 263 aa  166  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0060835  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2100  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.86 
 
 		 257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2766  motility protein A  31.87 
 
 		 259 aa  164  9e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000892451  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.55 
 
 		 255 aa  165  9e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.572139  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3364  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.86 
 
 		 257 aa  164  9e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0112135 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1970  flagellar motor protein  31.84 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2159  flagellar motor protein  31.43 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.193133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1544  flagellar motor protein MotP  38.34 
 
 		 277 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3905  flagellar motor protein  33.88 
 
 		 246 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.448269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.46 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362877  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.52 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.11 
 
 		 262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2933  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.68 
 
 		 255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>