More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0253 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0255  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 262 aa  519  1e-146  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0253  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 262 aa  519  1e-146  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1295  MotA/TolQ/ExbB proton channel  63.74 
 
 		 262 aa  341  5.999999999999999e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1535  MotA/TolQ/ExbB proton channel  61.83 
 
 		 262 aa  335  5.999999999999999e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.39 
 
 		 259 aa  258  6e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000377193  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16780  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.43 
 
 		 267 aa  237  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000859777  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.6 
 
 		 262 aa  232  5e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3589  chemotaxis protein MotA  45.63 
 
 		 254 aa  231  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.45 
 
 		 251 aa  229  4e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1402  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.63 
 
 		 266 aa  224  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.462015  normal  0.61336 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1172  proton conductor component of motor; no effect on switching  41.11 
 
 		 257 aa  211  7e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2425  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.51 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000186684  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1717  chemotaxis protein PomA  42.46 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.690132  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.28 
 
 		 252 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000718069  normal  0.214195 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.822271 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1017  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.33 
 
 		 263 aa  202  5e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2706  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.35 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0781  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.38 
 
 		 272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0578  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.23 
 
 		 261 aa  199  6e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2766  motility protein A  40 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000892451  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 		 265 aa  196  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0287  chemotaxis protein MotA (Motility protein A)  42.19 
 
 		 260 aa  196  3e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0494  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.87 
 
 		 272 aa  193  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.868711  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2988  flagellar motor protein PomA  41.18 
 
 		 255 aa  193  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.924494  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1012  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.8 
 
 		 253 aa  192  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1015  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.4 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.459149  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1072  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.62 
 
 		 265 aa  191  9e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2433  flagellar motor protein PomA  41.96 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4079  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.65 
 
 		 256 aa  189  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3836  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.46 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0179071 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2787  flagellar motor protein PomA  41.27 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.315605  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.46 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1538  chemotaxis protein MotA  41.41 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371855  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1269  chemotaxis protein PomA  38.49 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.942425  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2728  flagellar motor protein PomA  41.04 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00881641  normal  0.350024 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2801  flagellar motor protein PomA  41.04 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.349306  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.64 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1314  flagellar motor protein  37.14 
 
 		 246 aa  186  4e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.68 
 
 		 249 aa  185  6e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1278  flagellar motor protein PomA  40.64 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.398192  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.65 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2319  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.213848  hitchhiker  0.00117076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3326  flagellar motor protein PomA  39.53 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.582531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2898  flagellar motor protein PomA  40.64 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141177  hitchhiker  0.0000842214 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004255  Flagellar motor rotation protein MotA  39.37 
 
 		 253 aa  183  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.762495  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2768  flagellar motor protein PomA  40.32 
 
 		 255 aa  183  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1945  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.1 
 
 		 250 aa  182  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118211  normal  0.790191 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0239  hypothetical protein  42.92 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0060835  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0691  permease  40.16 
 
 		 255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.69 
 
 		 265 aa  181  8.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210731  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01176  flagellar motor protein PomA  38.98 
 
 		 253 aa  180  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3475  flagellar motor protein PomA  38.74 
 
 		 255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113278  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0031  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.95 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0653  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.2 
 
 		 260 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000451505 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3219  flagellar motor protein PomA  37.25 
 
 		 253 aa  178  7e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2568  flagellar motor protein PomA  39.68 
 
 		 255 aa  178  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.642903  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3027  chemotaxis MotA protein  37.96 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0461  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.05 
 
 		 254 aa  176  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0820  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.61 
 
 		 251 aa  176  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1858  flagellar motor protein  39.02 
 
 		 246 aa  176  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.403238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.8 
 
 		 251 aa  176  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0447441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1360  flagellar motor protein PomA  38.82 
 
 		 255 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0076192  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1346  flagellar motor protein PomA  38.82 
 
 		 255 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0968  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.58 
 
 		 256 aa  175  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1385  flagellar motor protein PomA  38.82 
 
 		 255 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3000  flagellar motor protein PomA  38.82 
 
 		 255 aa  175  8e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0822538  decreased coverage  0.0000000757228 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.86 
 
 		 261 aa  175  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0936  flagellar motor protein PomA  38 
 
 		 254 aa  175  8e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0279323  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2933  flagellar motor protein  33.88 
 
 		 246 aa  174  9e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1250  flagellar motor protein  37.14 
 
 		 245 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.910285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.91 
 
 		 277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.67 
 
 		 262 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1322  flagellar motor protein PomA  38.19 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.59 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2337  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.38 
 
 		 257 aa  172  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.516554  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1340  flagellar motor protein MotP  36.82 
 
 		 277 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.198794  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2568  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.47 
 
 		 261 aa  171  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2472  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.47 
 
 		 261 aa  171  9e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2159  flagellar motor protein  35.1 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.193133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1299  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.458392  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3905  flagellar motor protein  39.02 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.448269  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4336  flagellar motor protein  39.36 
 
 		 246 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0869231  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0415  flagellar motor protein PomA  38.8 
 
 		 254 aa  168  9e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0186256  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0744  flagellar motor protein  33.88 
 
 		 246 aa  168  9e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1531  flagellar motor protein  39.36 
 
 		 246 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270936  normal  0.422767 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0851  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.98 
 
 		 260 aa  168  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1397  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.82 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9942  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1949  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.47 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1092  flagellar motor protein PomA  38.04 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.46 
 
 		 251 aa  166  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0355  flagellar motor protein MotA  35.97 
 
 		 268 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1529  flagellar motor protein PomA  38.04 
 
 		 255 aa  165  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3423  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.84 
 
 		 245 aa  165  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3662  flagellar motor protein  38.15 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1343  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.18 
 
 		 246 aa  163  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428194  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3432  flagellar motor protein  36.18 
 
 		 246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.228788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.68 
 
 		 267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1746  flagellar motor protein MotP  36.84 
 
 		 277 aa  162  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1984  chemotaxis motA protein  36.18 
 
 		 246 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.258638  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1803  flagellar motor protein MotP  36.84 
 
 		 277 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>