More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0147 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
267 aa  525  1e-148  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0851  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.23 
 
 
260 aa  249  3e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566101  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.94 
 
 
260 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.22 
 
 
265 aa  231  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.32 
 
 
265 aa  222  4.9999999999999996e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2337  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.7 
 
 
257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.516554  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46 
 
 
265 aa  218  6e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210731  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31120  flagellar motor component  44.88 
 
 
253 aa  218  7.999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229766  normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0968  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.75 
 
 
256 aa  217  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2017  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.76 
 
 
261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.358452  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1660  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.94 
 
 
257 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.894652 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0653  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.6 
 
 
260 aa  208  9e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000451505 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.69 
 
 
277 aa  205  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163416  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2981  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.32 
 
 
276 aa  199  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.44999 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.72 
 
 
272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0355  flagellar motor protein MotA  36.94 
 
 
268 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2464  flagellar motor protein MotA  40.55 
 
 
263 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.407079  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0749  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.69 
 
 
255 aa  191  8e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0987  flagellar motor protein MotA  37.94 
 
 
263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.9 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.92 
 
 
252 aa  188  7e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000718069  normal  0.214195 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.25 
 
 
252 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.822271 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3027  chemotaxis MotA protein  37.14 
 
 
254 aa  186  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0461  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.73 
 
 
254 aa  185  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1072  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.22 
 
 
265 aa  183  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.3 
 
 
249 aa  182  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4079  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.19 
 
 
256 aa  183  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3589  chemotaxis protein MotA  34.78 
 
 
254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2568  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.58 
 
 
261 aa  181  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1343  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.78 
 
 
246 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428194  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.95 
 
 
261 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2472  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.58 
 
 
261 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0781  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.43 
 
 
272 aa  180  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00147223  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3836  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.73 
 
 
254 aa  180  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0179071 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1299  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.45 
 
 
255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.458392  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1172  proton conductor component of motor; no effect on switching  33.72 
 
 
257 aa  179  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38 
 
 
262 aa  179  4e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1402  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.05 
 
 
266 aa  179  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.462015  normal  0.61336 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.92 
 
 
254 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0031  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.66 
 
 
249 aa  178  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0614  flagellar motor protein MotA  34.73 
 
 
264 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2159  flagellar motor protein  37.14 
 
 
246 aa  176  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.193133  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2933  flagellar motor protein  36.59 
 
 
246 aa  174  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.619192  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16780  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.47 
 
 
267 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000859777  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1970  flagellar motor protein  36.73 
 
 
246 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0239  hypothetical protein  38.7 
 
 
263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0060835  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1717  chemotaxis protein PomA  35.83 
 
 
251 aa  172  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.690132  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3905  flagellar motor protein  38.78 
 
 
246 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.448269  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0578  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.14 
 
 
261 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1858  flagellar motor protein  37.96 
 
 
246 aa  172  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.403238  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2425  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.95 
 
 
279 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000186684  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45560  flagellar motor protein  39.18 
 
 
246 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.687243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4336  flagellar motor protein  37.96 
 
 
246 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0869231  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1984  chemotaxis motA protein  38.37 
 
 
246 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.258638  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0691  permease  36.58 
 
 
255 aa  171  2e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1314  flagellar motor protein  37.14 
 
 
246 aa  170  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.2 
 
 
251 aa  170  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1180  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.55 
 
 
247 aa  170  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2800  flagellar motor protein  38.37 
 
 
246 aa  169  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76835  normal  0.157366 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3866  flagellar motor protein  39.18 
 
 
246 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3662  flagellar motor protein  37.96 
 
 
246 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1531  flagellar motor protein  37.55 
 
 
246 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270936  normal  0.422767 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0314  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36 
 
 
258 aa  168  9e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0744  flagellar motor protein  35.92 
 
 
246 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1949  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.92 
 
 
246 aa  167  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3432  flagellar motor protein  37.96 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.228788  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1945  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.52 
 
 
250 aa  166  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118211  normal  0.790191 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1568  flagellar motor protein  37.55 
 
 
246 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709398  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1524  chemotaxis MotA protein  33.2 
 
 
248 aa  163  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4621  flagellar motor protein MotA  35.5 
 
 
264 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1015  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.8 
 
 
254 aa  161  1e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.459149  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0287  chemotaxis protein MotA (Motility protein A)  33.2 
 
 
260 aa  159  4e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1250  flagellar motor protein  37.14 
 
 
245 aa  159  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1295  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.18 
 
 
262 aa  157  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1269  chemotaxis protein PomA  33.6 
 
 
254 aa  157  1e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.942425  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2988  flagellar motor protein PomA  34.65 
 
 
255 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.924494  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2768  flagellar motor protein PomA  35.25 
 
 
255 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01428  flagellar motor protein PomA  37.15 
 
 
253 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2787  flagellar motor protein PomA  35.63 
 
 
255 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.315605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0264  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.62 
 
 
266 aa  156  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2766  motility protein A  35.02 
 
 
259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000892451  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
251 aa  155  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0447441  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2433  flagellar motor protein PomA  34.88 
 
 
255 aa  155  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1535  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.13 
 
 
262 aa  155  9e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0415  flagellar motor protein PomA  33.99 
 
 
254 aa  154  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0186256  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0255  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.68 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0253  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.68 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4341  flagellar motor protein MotA  35.88 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1278  flagellar motor protein PomA  35.66 
 
 
255 aa  152  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.398192  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00026  flagellar motor protein  35.17 
 
 
237 aa  152  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142899  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2706  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1092  flagellar motor protein PomA  33.33 
 
 
254 aa  152  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4287  chemotaxis motA protein  35.15 
 
 
244 aa  152  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1385  flagellar motor protein PomA  36.05 
 
 
255 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1346  flagellar motor protein PomA  36.05 
 
 
255 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1360  flagellar motor protein PomA  36.05 
 
 
255 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0076192  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004255  Flagellar motor rotation protein MotA  32.02 
 
 
253 aa  150  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.762495  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3475  flagellar motor protein PomA  34.1 
 
 
255 aa  150  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113278  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1322  flagellar motor protein PomA  33.99 
 
 
254 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3212  flagellar motor protein MotA  36.64 
 
 
264 aa  149  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>