263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3326 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3326  flagellar motor protein PomA  100 
 
 		 255 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.582531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3475  flagellar motor protein PomA  90.2 
 
 		 255 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113278  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2768  flagellar motor protein PomA  89.8 
 
 		 255 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2988  flagellar motor protein PomA  87.4 
 
 		 255 aa  449  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.924494  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2433  flagellar motor protein PomA  84.31 
 
 		 255 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2728  flagellar motor protein PomA  83.14 
 
 		 255 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00881641  normal  0.350024 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2801  flagellar motor protein PomA  83.14 
 
 		 255 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.349306  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2787  flagellar motor protein PomA  82.75 
 
 		 255 aa  436  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.315605  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2898  flagellar motor protein PomA  83.14 
 
 		 255 aa  437  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141177  hitchhiker  0.0000842214 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2568  flagellar motor protein PomA  81.96 
 
 		 255 aa  433  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.642903  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3000  flagellar motor protein PomA  81.18 
 
 		 255 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0822538  decreased coverage  0.0000000757228 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1385  flagellar motor protein PomA  81.18 
 
 		 255 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1346  flagellar motor protein PomA  81.18 
 
 		 255 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1360  flagellar motor protein PomA  81.18 
 
 		 255 aa  428  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0076192  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1278  flagellar motor protein PomA  81.57 
 
 		 255 aa  428  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.398192  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1529  flagellar motor protein PomA  80 
 
 		 255 aa  425  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1092  flagellar motor protein PomA  71.94 
 
 		 254 aa  369  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0936  flagellar motor protein PomA  70.92 
 
 		 254 aa  368  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0279323  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01176  flagellar motor protein PomA  71.03 
 
 		 253 aa  361  6e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004255  Flagellar motor rotation protein MotA  70.24 
 
 		 253 aa  360  1e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.762495  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1322  flagellar motor protein PomA  67.98 
 
 		 254 aa  352  5e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01428  flagellar motor protein PomA  65.59 
 
 		 253 aa  340  2e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0415  flagellar motor protein PomA  69.2 
 
 		 254 aa  333  1e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0186256  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  57.49 
 
 		 251 aa  290  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0447441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3219  flagellar motor protein PomA  54.55 
 
 		 253 aa  288  5.0000000000000004e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0833  flagellar motor protein PomA  56.08 
 
 		 256 aa  275  4e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0314  MotA/TolQ/ExbB proton channel  53.04 
 
 		 258 aa  263  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1299  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.458392  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1945  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.2 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118211  normal  0.790191 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3589  chemotaxis protein MotA  44.44 
 
 		 254 aa  228  7e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0338  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.56 
 
 		 288 aa  226  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.25 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1717  chemotaxis protein PomA  44.13 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.690132  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0578  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.4 
 
 		 261 aa  221  9e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1172  proton conductor component of motor; no effect on switching  44.8 
 
 		 257 aa  216  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1402  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.41 
 
 		 266 aa  215  5e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.462015  normal  0.61336 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0049  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.32 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969592  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2319  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.11 
 
 		 250 aa  209  4e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.213848  hitchhiker  0.00117076 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.4 
 
 		 252 aa  205  5e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.822271 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1397  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.51 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9942  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0781  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.36 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42 
 
 		 262 aa  194  9e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.8 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0425767  normal  0.0158705 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16780  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000859777  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1015  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.13 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.459149  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2425  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.96 
 
 		 279 aa  187  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000186684  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0233  flagellar motor protein MotA  42.57 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.961919  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1875  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.57 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0131395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.46 
 
 		 255 aa  187  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.572139  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2078  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.39 
 
 		 257 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.174751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3364  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.78 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0112135 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1394  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.7 
 
 		 253 aa  185  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2706  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.35 
 
 		 266 aa  185  6e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2100  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.23 
 
 		 257 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1538  chemotaxis protein MotA  36.69 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371855  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1012  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.69 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5375  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.13 
 
 		 257 aa  183  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.953514  normal  0.486184 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0691  permease  40.94 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4830  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.7 
 
 		 272 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5297  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.7 
 
 		 257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.971725 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.76 
 
 		 257 aa  181  7e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362877  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.68 
 
 		 252 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000718069  normal  0.214195 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1269  chemotaxis protein PomA  39.04 
 
 		 254 aa  174  9e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.942425  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.04 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.27 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0820  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.08 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1236  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.89 
 
 		 257 aa  172  5e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.894352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1295  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.31 
 
 		 262 aa  172  5e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0253  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.53 
 
 		 262 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0255  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.53 
 
 		 262 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1495  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.68 
 
 		 257 aa  171  9e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00626739  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2766  motility protein A  34.8 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000892451  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3510  putative chemotaxis protein MotA (flagellar motor component)  37.2 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0653  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.2 
 
 		 260 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000451505 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.26 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210731  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1535  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.86 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4079  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.22 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0461  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.82 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0541  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.8 
 
 		 272 aa  161  9e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1072  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.09 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0287  chemotaxis protein MotA (Motility protein A)  35.97 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.61 
 
 		 265 aa  159  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0031  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.2 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.66 
 
 		 249 aa  155  6e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3836  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.6 
 
 		 254 aa  155  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0179071 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1340  flagellar motor protein MotP  34.66 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.198794  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.39 
 
 		 254 aa  151  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.29 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.57 
 
 		 267 aa  149  3e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3027  chemotaxis MotA protein  31.58 
 
 		 254 aa  148  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0851  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.65 
 
 		 260 aa  148  8e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1314  flagellar motor protein  32.26 
 
 		 246 aa  148  9e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1504  flagellar motor protein MotP  34.38 
 
 		 277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.886706  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1515  flagellar motor protein MotP  34.38 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1725  flagellar motor protein MotP  34.38 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1746  flagellar motor protein MotP  34.38 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.1 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1803  flagellar motor protein MotP  34.38 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2159  flagellar motor protein  34.13 
 
 		 246 aa  145  7.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.193133  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>