293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0541 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0541  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 272 aa  531  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1172  proton conductor component of motor; no effect on switching  39.84 
 
 		 257 aa  187  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1322  flagellar motor protein PomA  40.8 
 
 		 254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004255  Flagellar motor rotation protein MotA  41.6 
 
 		 253 aa  182  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.762495  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.4 
 
 		 251 aa  182  6e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3589  chemotaxis protein MotA  36.8 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1717  chemotaxis protein PomA  38.8 
 
 		 251 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.690132  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01176  flagellar motor protein PomA  40.8 
 
 		 253 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01428  flagellar motor protein PomA  41.2 
 
 		 253 aa  176  4e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2319  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.2 
 
 		 250 aa  172  5e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.213848  hitchhiker  0.00117076 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.04 
 
 		 252 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.822271 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0936  flagellar motor protein PomA  39.84 
 
 		 254 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0279323  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1945  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.04 
 
 		 250 aa  168  8e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118211  normal  0.790191 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3219  flagellar motor protein PomA  37.85 
 
 		 253 aa  168  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1299  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.6 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.458392  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3326  flagellar motor protein PomA  36.8 
 
 		 255 aa  166  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.582531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0781  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.44 
 
 		 272 aa  166  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0415  flagellar motor protein PomA  40.24 
 
 		 254 aa  166  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0186256  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1092  flagellar motor protein PomA  38 
 
 		 254 aa  165  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1278  flagellar motor protein PomA  37.6 
 
 		 255 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.398192  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2768  flagellar motor protein PomA  38 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.400451 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2433  flagellar motor protein PomA  38 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.4 
 
 		 252 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000718069  normal  0.214195 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0314  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.2 
 
 		 258 aa  161  9e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2787  flagellar motor protein PomA  37.2 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.315605  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1529  flagellar motor protein PomA  36.4 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2988  flagellar motor protein PomA  37.2 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.924494  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2568  flagellar motor protein PomA  37.6 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.642903  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3000  flagellar motor protein PomA  38.4 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0822538  decreased coverage  0.0000000757228 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1346  flagellar motor protein PomA  38 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0615563  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1360  flagellar motor protein PomA  38 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0076192  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1385  flagellar motor protein PomA  38 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2728  flagellar motor protein PomA  36.8 
 
 		 255 aa  159  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00881641  normal  0.350024 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2801  flagellar motor protein PomA  36.8 
 
 		 255 aa  159  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.349306  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2898  flagellar motor protein PomA  36.4 
 
 		 255 aa  158  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141177  hitchhiker  0.0000842214 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3475  flagellar motor protein PomA  36 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113278  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1402  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.8 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.462015  normal  0.61336 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0578  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.83 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16780  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.8 
 
 		 267 aa  155  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000859777  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1394  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.69 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0049  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.55 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969592  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.52 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0447441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1295  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.07 
 
 		 262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1012  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.65 
 
 		 253 aa  152  4e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0833  flagellar motor protein PomA  38.04 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1015  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.45 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.459149  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1397  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9942  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0233  flagellar motor protein MotA  34.9 
 
 		 253 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.961919  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1875  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.9 
 
 		 253 aa  149  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0131395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0338  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.04 
 
 		 288 aa  148  9e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0691  permease  37.07 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1269  chemotaxis protein PomA  36.47 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.942425  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0255  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.84 
 
 		 262 aa  145  6e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0253  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.84 
 
 		 262 aa  145  6e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0653  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.26 
 
 		 260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000451505 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0820  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.6 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.86 
 
 		 265 aa  142  8e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2425  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.72 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000186684  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2706  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.97 
 
 		 266 aa  139  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.73 
 
 		 265 aa  139  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0287  chemotaxis protein MotA (Motility protein A)  34.65 
 
 		 260 aa  138  8.999999999999999e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.04 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1535  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.55 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1340  flagellar motor protein MotP  31.68 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.198794  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1538  chemotaxis protein MotA  35.06 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371855  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.6 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2078  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.82 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.174751  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4287  chemotaxis motA protein  31.9 
 
 		 244 aa  130  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2100  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.41 
 
 		 257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.68 
 
 		 267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1504  flagellar motor protein MotP  30.08 
 
 		 277 aa  126  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.886706  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2975  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.2 
 
 		 285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3364  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.05 
 
 		 257 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0112135 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0987  flagellar motor protein MotA  29.37 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1803  flagellar motor protein MotP  28.74 
 
 		 277 aa  125  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1746  flagellar motor protein MotP  28.74 
 
 		 277 aa  125  9e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4999  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.38 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.567523 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1515  flagellar motor protein MotP  30.08 
 
 		 277 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1725  flagellar motor protein MotP  30.08 
 
 		 277 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.46 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362877  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1544  flagellar motor protein MotP  29.55 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3510  putative chemotaxis protein MotA (flagellar motor component)  32.68 
 
 		 257 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1539  flagellar motor protein MotP  31.6 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1072  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.83 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1658  flagellar motor protein MotP  31.6 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169098  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5375  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.42 
 
 		 257 aa  123  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.953514  normal  0.486184 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2766  motility protein A  29.48 
 
 		 259 aa  122  5e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000892451  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.6 
 
 		 251 aa  122  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2075  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.93 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.921977  normal  0.338656 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0494  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.35 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.868711  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.27 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.81 
 
 		 265 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210731  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5297  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.5 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.971725 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2464  flagellar motor protein MotA  28.57 
 
 		 263 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.407079  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.88 
 
 		 272 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4830  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.06 
 
 		 272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1017  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.68 
 
 		 263 aa  119  6e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.82 
 
 		 292 aa  119  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1693  flagellar motor protein MotP  31.95 
 
 		 277 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>